More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf296 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 235 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  41.15 
 
 		 277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  35.74 
 
 		 271 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0791  protein methyltransferase HemK  34.29 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.012343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1070  modification methylase, HemK family  35.1 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.31401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  34.73 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  34.6 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  33.82 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  35.35 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  36.99 
 
 		 359 aa  113  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  33.66 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.3 
 
 		 276 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  30.69 
 
 		 294 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  34.78 
 
 		 284 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  33.64 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0950  modification methylase HemK  33.02 
 
 		 277 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  31.19 
 
 		 283 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.75 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.97 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  33.82 
 
 		 285 aa  108  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.15 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  32.84 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.97 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  28.69 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.54 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  34.95 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  31.19 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  27.7 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.88 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  31.9 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  35.58 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  31.88 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  32.05 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.2 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  33.88 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.2 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  28.51 
 
 		 308 aa  105  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.2 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  29.58 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  32.06 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  32.04 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.2 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  32.86 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  32.56 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  32.85 
 
 		 276 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.2 
 
 		 277 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  33.33 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  32.86 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  33.01 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  32.23 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  36.87 
 
 		 361 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  32.86 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  35.32 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  30.7 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  33.33 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  31.13 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.4 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  32.04 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  28.63 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  32.08 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  30.1 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  32.26 
 
 		 284 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  32.7 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  32.35 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61680  putative methyl transferase  32.7 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  34.43 
 
 		 284 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  34.13 
 
 		 285 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  32.04 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.61 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.1 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.14 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  32.02 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.62 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  31.03 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  31.1 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.98 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  30.45 
 
 		 283 aa  101  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.43 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  30.84 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  34.25 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  29.76 
 
 		 288 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  28.45 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  34.78 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  30.43 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.43 
 
 		 277 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  29.57 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  30.88 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  32.11 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.86 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.1 
 
 		 276 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  32.38 
 
 		 285 aa  99.4  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.17 
 
 		 281 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0802  HemK family modification methylase  32.7 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0840455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  28.84 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.09 
 
 		 295 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.62 
 
 		 276 aa  99.4  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  29.72 
 
 		 286 aa  99.4  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  28.57 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.13 
 
 		 286 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>