168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26420 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  54.89 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  33.09 
 
 
279 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  34.51 
 
 
271 aa  148  9e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  28.1 
 
 
279 aa  129  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  34.42 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  32.27 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  32.07 
 
 
279 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.13 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.87 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  31.03 
 
 
268 aa  92  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  30.47 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  26.92 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  22.34 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  32.59 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  35.56 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  26.19 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  31.52 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  24.4 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  27.27 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  24.81 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  28.04 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  28.5 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  31.21 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  27.27 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  31.22 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  29.82 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.99 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  25.75 
 
 
294 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  28.27 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  30.15 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  22.1 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  23.35 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  27.86 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  24.57 
 
 
278 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  28.05 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.11 
 
 
352 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  31.06 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  26.41 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  27.01 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  23.98 
 
 
286 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  28.1 
 
 
276 aa  58.9  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  25.88 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  25.88 
 
 
273 aa  58.5  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  29.85 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  25.58 
 
 
319 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  26.58 
 
 
295 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  34.69 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  34.55 
 
 
289 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  23.92 
 
 
278 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  25.11 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  27.86 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  23.96 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.24 
 
 
209 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  26.55 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  25.64 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
298 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  25.38 
 
 
237 aa  52  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  35 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
278 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  23.78 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2205  Methyltransferase type 11  41.43 
 
 
190 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.450687  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  37.5 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  22.22 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  30.28 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  23.92 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  26.7 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  35.37 
 
 
224 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  23.36 
 
 
241 aa  49.3  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 
207 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  25.74 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
281 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  47.37 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.7 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.1 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
581 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  32.98 
 
 
257 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
189 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
274 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  29.77 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 
250 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  38.24 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  38.24 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  38.24 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  33.68 
 
 
256 aa  45.8  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0671  methyltransferase type 11  48.84 
 
 
312 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>