More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3123 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3123  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36390  hypothetical protein  88.99 
 
 		 316 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  57.53 
 
 		 322 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  57.14 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  55.66 
 
 		 317 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5559  hypothetical protein  53 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  54.25 
 
 		 321 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  57.19 
 
 		 317 aa  311  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  52.41 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  51.56 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  50.62 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  52.37 
 
 		 341 aa  291  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  52.1 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  54.72 
 
 		 317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  54.4 
 
 		 316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  51.27 
 
 		 315 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2978  methyltransferase small  53 
 
 		 461 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514386  normal  0.292811 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  33.56 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  33.56 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  34.23 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  32.88 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.65 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  39.23 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  35.92 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  40.32 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  38.13 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  38.13 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  40.46 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1326  modification methylase, HemK family  36 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.695473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2487  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0920216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2708  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2482  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  36.77 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  37.21 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.09 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  37.69 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2625  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.33 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1322  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.33 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02255  N5-glutamine methyltransferase  35.33 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02215  hypothetical protein  35.33 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  35.14 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3471  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.33 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  42.67 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  35.66 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  46.67 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  34.97 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  37.59 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  28.86 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  29.61 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  48.68 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  30.87 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1870  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  33.59 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  45.83 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2878  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.67 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123822  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1017  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.54 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.51 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  30.87 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  30.87 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.48 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  30.87 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.8 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  30.43 
 
 		 359 aa  62.4  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  34.48 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  30.87 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  30.87 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.4 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1546  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.65 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  32.54 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  31.79 
 
 		 484 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  31.5 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.8 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.8 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2160  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.1 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2594  modification methylase, HemK family  32.9 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  30.49 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  33.94 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.8 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  33.94 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1344  modification methylase, HemK family  35.33 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2770  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.97 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526087  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  38.57 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2847  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.97 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000091809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.46 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1606  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.97 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  0.243081 
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  36.59 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  36.15 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1536  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.18 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1893  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.21 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  37.01 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  32.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.76 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.62 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  30.2 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2753  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.27 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0853524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  37.1 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.36 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>