More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1382 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1364  methyltransferase small  100 
 
 
507 aa  996    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4693  methyltransferase small  77.51 
 
 
502 aa  730    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.245797  normal  0.0884272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1382  methyltransferase small  100 
 
 
507 aa  996    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1773  methyltransferase small  79.68 
 
 
505 aa  748    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.688514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1398  methyltransferase small  97.04 
 
 
507 aa  923    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1985  methyltransferase small  67.67 
 
 
514 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0188914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3782  methyltransferase small  53.78 
 
 
509 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11426  normal  0.868268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1468  methyltransferase small  43.86 
 
 
494 aa  334  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24460  methyltransferase family protein  42.66 
 
 
498 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639054  normal  0.384548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1428  methyltransferase small  43.54 
 
 
494 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8445  methyltransferase small  41.07 
 
 
496 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2758  methyltransferase small  42.69 
 
 
515 aa  295  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  decreased coverage  0.00000342693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1495  methyltransferase small  41.95 
 
 
498 aa  292  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242614  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32720  methyltransferase family protein  38.35 
 
 
549 aa  289  7e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676312  normal  0.572008 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25140  methyltransferase family protein  40.84 
 
 
522 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0342  methyltransferase small  42.72 
 
 
572 aa  279  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0486  methyltransferase small  41.72 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.120857  decreased coverage  0.00163272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0374  methyltransferase small  39.56 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0335186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9295  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  39.59 
 
 
480 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2204  methyltransferase small  36.33 
 
 
536 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345571  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1835  methyltransferase small  40.42 
 
 
494 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3521  methyltransferase small  40.83 
 
 
490 aa  257  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.945022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5079  methyltransferase small  36.44 
 
 
481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0289  methyltransferase small  41.48 
 
 
484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0238  hypothetical protein  37.6 
 
 
494 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3358  methyltransferase small  37.08 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4180  methyltransferase small  40.04 
 
 
498 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3150  methyltransferase small  39.77 
 
 
549 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.998334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0638  methyltransferase small  39.83 
 
 
508 aa  236  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26100  methyltransferase family protein  35.76 
 
 
525 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18100  methyltransferase family protein  38.9 
 
 
558 aa  190  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.402919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0499  methyltransferase small  34.55 
 
 
363 aa  90.5  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  35.23 
 
 
376 aa  86.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.08 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  35 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1425  methyltransferase small  35.64 
 
 
321 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  44.35 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.55 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.78 
 
 
286 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  31.16 
 
 
206 aa  69.3  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  34.09 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0617  bifunctional methyltransferase  29.41 
 
 
262 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.951183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  34.44 
 
 
284 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  36.71 
 
 
317 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2303  methyltransferase small  34.16 
 
 
322 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  37.11 
 
 
274 aa  65.1  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  29.91 
 
 
210 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  34.36 
 
 
281 aa  63.9  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2658  methyltransferase small  35.51 
 
 
317 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  34.42 
 
 
372 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  34.9 
 
 
284 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  29.91 
 
 
210 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.42 
 
 
276 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2522  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.88 
 
 
340 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  36.05 
 
 
280 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  41.13 
 
 
286 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  40.79 
 
 
285 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  33.76 
 
 
341 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.1 
 
 
307 aa  60.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  36.42 
 
 
276 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2463  methyltransferase small  33.76 
 
 
340 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.63 
 
 
285 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  35.76 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2934  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.86 
 
 
299 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.43 
 
 
330 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1751  methyltransferase small  36.17 
 
 
198 aa  58.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.760844  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2096  methyltransferase small  32.31 
 
 
317 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0949544  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  39.74 
 
 
285 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2685  methyltransferase small  31.07 
 
 
341 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 
277 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0303  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.6 
 
 
340 aa  58.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  34.88 
 
 
198 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2567  methyltransferase small  34.39 
 
 
315 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.65 
 
 
317 aa  57.8  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2509  methyltransferase small  34.85 
 
 
317 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644034  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  42.11 
 
 
279 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35 
 
 
275 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3252  HemK family modification methylase  35.38 
 
 
316 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.552537  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.16 
 
 
340 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3360  putative methylase  34.92 
 
 
236 aa  57  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476514  normal  0.0128245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  33.53 
 
 
283 aa  57  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  31.39 
 
 
365 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  34.19 
 
 
284 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  24.28 
 
 
262 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1622  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  32.76 
 
 
407 aa  56.6  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.254122 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  44.16 
 
 
295 aa  56.6  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  32.22 
 
 
201 aa  56.6  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  46.15 
 
 
275 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  37.11 
 
 
359 aa  55.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2451  methylase  43.33 
 
 
223 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1236  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.72 
 
 
303 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  25.52 
 
 
202 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3467  methylase  37.37 
 
 
231 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0579  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.04 
 
 
280 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  32.05 
 
 
200 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.48 
 
 
347 aa  53.9  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  33.11 
 
 
276 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  28.9 
 
 
342 aa  53.5  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  30.23 
 
 
200 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  41.11 
 
 
285 aa  53.5  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>