More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0111 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  100 
 
 
211 aa  420  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  37.88 
 
 
241 aa  151  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
256 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  33.01 
 
 
241 aa  145  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  38.94 
 
 
256 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
260 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  30.62 
 
 
251 aa  141  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  37.19 
 
 
249 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  35.71 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  32.7 
 
 
249 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  33.01 
 
 
241 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  33.01 
 
 
241 aa  135  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  31.75 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  37.8 
 
 
258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  38.76 
 
 
266 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  39.2 
 
 
255 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  35.03 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  36.76 
 
 
258 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  32.65 
 
 
249 aa  124  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  32.31 
 
 
240 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  33.65 
 
 
246 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  29.19 
 
 
248 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  33.33 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  31.28 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  31.12 
 
 
246 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  31.28 
 
 
246 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  31.28 
 
 
246 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  31.28 
 
 
246 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  31.12 
 
 
246 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  30.77 
 
 
246 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  30.77 
 
 
246 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  28.34 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  32.18 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  28.85 
 
 
240 aa  112  5e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  29.59 
 
 
246 aa  111  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  29.74 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  35.78 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  29.08 
 
 
220 aa  109  3e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
248 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  30.81 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.98 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  35.47 
 
 
268 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  27.92 
 
 
254 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  26.98 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  25.98 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  27.67 
 
 
254 aa  92  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  23 
 
 
243 aa  91.3  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  22.97 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  22.27 
 
 
254 aa  85.1  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  33.02 
 
 
250 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  31.63 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  32.09 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  33.82 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  26.92 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  26.89 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  24.49 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  29.7 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  29.26 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  24.14 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  22.79 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  27.88 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  31.85 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  30.23 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  30.05 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  26.26 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  32.8 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  22.64 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  25 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  36.92 
 
 
438 aa  72.4  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  34.55 
 
 
255 aa  72  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  28.97 
 
 
260 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  32.84 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.83 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  35.11 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  26.13 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  21.11 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  30 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  29.28 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  23.74 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  20.2 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  25.4 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  26.18 
 
 
237 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  31.12 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  22.28 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.61 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  26.88 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  26.88 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  30.88 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  26.88 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  22.75 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  21.82 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  21.2 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  30.85 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  28.92 
 
 
262 aa  64.7  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  25.68 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  21.67 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  27.75 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  27.34 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  24.88 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>