272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2444 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  61.98 
 
 
254 aa  315  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  61.25 
 
 
254 aa  314  8e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  47.33 
 
 
251 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  48.15 
 
 
254 aa  227  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  45.23 
 
 
249 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  43.15 
 
 
249 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  44.21 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  44.21 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  44.21 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  44.21 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  44.21 
 
 
246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  44.21 
 
 
246 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  43.8 
 
 
246 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  44.21 
 
 
246 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  43.8 
 
 
246 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  44.03 
 
 
246 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  42.98 
 
 
246 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  38.33 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  38.49 
 
 
251 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  34.58 
 
 
241 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  34.58 
 
 
241 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
260 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  38.91 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  40.36 
 
 
240 aa  165  5e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  35.8 
 
 
249 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  35.12 
 
 
249 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
256 aa  164  9e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  37.82 
 
 
248 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  37.1 
 
 
220 aa  155  7e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  36.74 
 
 
228 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  32.64 
 
 
251 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  32.91 
 
 
245 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.8 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  34.45 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  30.83 
 
 
249 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  30.54 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  28.95 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  32.08 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  29.46 
 
 
256 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  30.29 
 
 
255 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
248 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  29.96 
 
 
233 aa  115  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  28.75 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  30.25 
 
 
262 aa  113  3e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.36 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  29.72 
 
 
240 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  27.57 
 
 
266 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25.62 
 
 
263 aa  103  2e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  26.67 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  28.63 
 
 
252 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  23 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  29.55 
 
 
268 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  25.97 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  27.98 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  24.5 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  27.35 
 
 
235 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  25.69 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  25.1 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  23.81 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  22.92 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  26.7 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  25.53 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  24.43 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  23.29 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  27.97 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  24.45 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  24.73 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  22.48 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  28.08 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  25.27 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  26.04 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  25.25 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  29.66 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  24.02 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.84 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  27.9 
 
 
275 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  26.13 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  26.71 
 
 
243 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  22.41 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  22.16 
 
 
249 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  26.83 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  24.38 
 
 
235 aa  62.4  0.000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  29.55 
 
 
398 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  25.36 
 
 
250 aa  62  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  21.1 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  23.26 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  23.04 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  27.33 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  25.34 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  27.93 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  28.95 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  24.77 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  25.15 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  24.05 
 
 
272 aa  55.5  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  25.26 
 
 
259 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  22.73 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  22.81 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  22.73 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  21.99 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>