More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3373 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  100 
 
 		 243 aa  504  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  40.74 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  40.41 
 
 		 238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  39.36 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  39.83 
 
 		 240 aa  152  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  37.4 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  37.08 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  36.78 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  34.16 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  34.16 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  34.16 
 
 		 248 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  35.63 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  35.48 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  35.12 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  36.78 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  36.78 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.12 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  35.12 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  32.08 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  35.12 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  35.12 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  35.12 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  32.08 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  35.12 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  35.12 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  37.19 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  34.98 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  35.92 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  34.96 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  34.71 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  32.26 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  31.25 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 238 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  35.12 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  31.64 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  32.64 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  33.33 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  33.07 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  33.6 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  33.73 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  38.67 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  36.4 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  32.08 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  37.7 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  34.21 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  34.59 
 
 		 236 aa  112  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  31.68 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  30.8 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  31.72 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  36.46 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  33.48 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  31.82 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  30.05 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  25.4 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  22.22 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  22.7 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  32.5 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  27.63 
 
 		 251 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  37.66 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  25.31 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  29.33 
 
 		 414 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  23.62 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  24.39 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  37.08 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  40 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  23.42 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7889  methyltransferase small  28.79 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  20.73 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1456  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.93 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000347757  normal  0.132252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1896  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.05 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  32.95 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.56 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.62 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3613  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.43 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.283182  normal  0.0446464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  34 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  31.62 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4061  methyltransferase small  30.52 
 
 		 338 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.656356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3151  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.39 
 
 		 314 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1993  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.29 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1261  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.88 
 
 		 300 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0715503  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.08 
 
 		 365 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  22.64 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2436  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  33.87 
 
 		 352 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.326287  normal  0.177296 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1821  modification methylase HemK  30.93 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  26.87 
 
 		 289 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.75 
 
 		 394 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1325  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.72 
 
 		 300 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1893  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.88 
 
 		 309 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  27.22 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0493  methyltransferase small  39.24 
 
 		 372 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0959915  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  27.93 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  27.12 
 
 		 303 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19340  protein-L-isoaspartate carboxylmethyltransferase  29.17 
 
 		 377 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165087  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.87 
 
 		 302 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  38.1 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  27.12 
 
 		 303 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>