More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3970 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  100 
 
 		 263 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  37.4 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  38.31 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  36.64 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  36.4 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  36.74 
 
 		 253 aa  161  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  36.02 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.63 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  35.63 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  35.63 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  36.88 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  35.63 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  35.63 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  35.63 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  35.63 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  35.85 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  35.74 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  35.36 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  35.36 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  38.7 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  34.1 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  33.98 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  35.11 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  35.66 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  34.62 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  32.82 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  32.68 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  35.63 
 
 		 238 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  30.65 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  35.63 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  35.36 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  32.68 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  34.87 
 
 		 238 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  34.87 
 
 		 238 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  32 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  33.96 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  33.59 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  32.82 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  30 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  32.31 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  31.92 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  31.94 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  30.8 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  33.85 
 
 		 255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  31.92 
 
 		 241 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  33.61 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  31.68 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  31.68 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  29.73 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  29.5 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  31.58 
 
 		 220 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.88 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  26.58 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.75 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  35.61 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  25.14 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.81 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  27.1 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.54 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.95 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  31.62 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1456  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.95 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000347757  normal  0.132252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  23.84 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.77 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.77 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  22.81 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  30.06 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  27.06 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  26.92 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  24 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  21.26 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  29.2 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  32.71 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1415  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.77 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.270918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1480  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.77 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.760634  normal  0.328142 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  32.71 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2160  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.77 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.971286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  31.62 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.21 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.62 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1270  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34 
 
 		 308 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  27.81 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  24.41 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  32.53 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.33 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2197  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.69 
 
 		 317 aa  52.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.8 
 
 		 281 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1870  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.77 
 
 		 299 aa  52.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  24.54 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.64 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  30.69 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2847  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.46 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000091809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2452  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.46 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1606  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.46 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  0.243081 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.34 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2770  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.46 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2753  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.46 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0853524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03115  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.38 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0895  HemK family modification methylase  28.68 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00424484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>