248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3526 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  100 
 
 
238 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  98.74 
 
 
238 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  97.06 
 
 
238 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  97.06 
 
 
238 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  65.82 
 
 
238 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  59.17 
 
 
241 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  59.24 
 
 
236 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  59.24 
 
 
236 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  55.74 
 
 
244 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  57.92 
 
 
220 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  53.2 
 
 
251 aa  254  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  54.92 
 
 
243 aa  245  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  52.07 
 
 
243 aa  244  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  50.57 
 
 
264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  47.73 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  45.15 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  42.37 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  39.66 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  40.93 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  38.24 
 
 
236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  37.13 
 
 
248 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  37.82 
 
 
236 aa  158  7e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  37.82 
 
 
240 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  35.95 
 
 
239 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  41.44 
 
 
215 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  36.97 
 
 
240 aa  149  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  37.82 
 
 
245 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.82 
 
 
245 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  37.82 
 
 
245 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  37.82 
 
 
245 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  37.82 
 
 
245 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  37.82 
 
 
245 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  37.82 
 
 
245 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  37.82 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  37.45 
 
 
248 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  36.67 
 
 
265 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  37.82 
 
 
245 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  37.24 
 
 
260 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  35.56 
 
 
248 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  35.56 
 
 
248 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  32.23 
 
 
235 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  35.15 
 
 
252 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  32.77 
 
 
234 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  37.13 
 
 
245 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  35.71 
 
 
248 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  32.08 
 
 
243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  35 
 
 
255 aa  132  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  35.63 
 
 
263 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  34.47 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  32.95 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  31.35 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.77 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  26.06 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  22.06 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  26.09 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  23.94 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  21.4 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  28.16 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  23.04 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  21.74 
 
 
251 aa  62.8  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  25.93 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  31.58 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  20.83 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  22.47 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  28.92 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  28.96 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  22.17 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  25.86 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  26.7 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  21.2 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  27.5 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  22.49 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  22.79 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  22.79 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  27.46 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  26 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  24.8 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  23.08 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  20.18 
 
 
330 aa  56.2  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  24.66 
 
 
245 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.93 
 
 
253 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  24.05 
 
 
256 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  22.73 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  25.86 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  26.09 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  27.96 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  20.61 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  25.22 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  25.22 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3505  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.41 
 
 
302 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  20.67 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  25.22 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  20.67 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.22 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.22 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  27.89 
 
 
247 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  22.65 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>