More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00784 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  100 
 
 		 253 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  36.74 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  35.69 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  34.13 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.92 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  34.92 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  34.52 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  34.92 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  34.92 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  34.92 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  32.55 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  34.92 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  32.28 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  32.28 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  32.28 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  32.28 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  33.73 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  33.73 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  34.51 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  33.46 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  36.86 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  33.86 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  33.99 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  31.75 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  32.57 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  31.89 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  32.14 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  31.39 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  31.64 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  31.42 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  33.2 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  31.68 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 238 aa  123  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  33.05 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  29.46 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  30.68 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  30.28 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  32.95 
 
 		 238 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  33.33 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  33.46 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  34.9 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  33.46 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  31.01 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  30.86 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  30.86 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  32.92 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  33.85 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  29.08 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  29.43 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  29.96 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  30.8 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  26.75 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  25.12 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25.74 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  29.73 
 
 		 240 aa  72  0.000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  23.6 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  23.6 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  29.88 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  28.49 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  23.77 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  21.95 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  26.24 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  22.75 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  23.24 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  26.78 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  24.32 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.05 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  22.68 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  35.63 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  35.63 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.63 
 
 		 354 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  21.78 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  21.89 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  31.19 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0822  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.608394  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.16 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3151  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.78 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1358  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.66 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.776581  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  23.46 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1017  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.62 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1456  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.04 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000347757  normal  0.132252 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  32.11 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2418  modification methylase HemK  27.61 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  27.59 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  23.77 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1636  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.04 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00333563  hitchhiker  0.00305068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0928  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.27 
 
 		 394 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000522839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0701  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  23.48 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  30.58 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  32.8 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  34.12 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1427  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  31.25 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  22.22 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3142  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  31.58 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.764065  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3080  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.87 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  22.3 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1546  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.5 
 
 		 310 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1468  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  35.87 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0232293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>