242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0893 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  100 
 
 		 243 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  68.44 
 
 		 244 aa  337  8e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  54.03 
 
 		 238 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  54.92 
 
 		 238 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  50.41 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  53.63 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  53.63 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  50.41 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  50 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  50 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  46.61 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  46.59 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  47.52 
 
 		 238 aa  215  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  46.37 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  42.16 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  48.02 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  43.15 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  41.32 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  38.93 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  39.26 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.86 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  37.86 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  37.86 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  37.86 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  37.86 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  37.86 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  36.48 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  36.48 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  37.86 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  37.6 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  36.36 
 
 		 245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  36.07 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  36.78 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  37.3 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  37.45 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  39.21 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  36.1 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  35.95 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  36.36 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  36.78 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  37.19 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  34.16 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  34.57 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  35.39 
 
 		 236 aa  135  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  34.16 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  32.26 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  32.1 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  33.96 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  31.01 
 
 		 253 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  29.64 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  24.43 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  23.21 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  23.89 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  23.89 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  23.89 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  23.89 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  23.89 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  23.89 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  23.89 
 
 		 246 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  25 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  23.53 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  23.45 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  25 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  23.45 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  22.77 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  24.84 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  26.39 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  26.71 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  25 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  22.78 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  21.33 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  24.58 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  23.94 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  21.59 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  24.11 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  23.61 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  27.03 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  20.91 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  22.92 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  24.18 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  22.73 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  28.78 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  24.47 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  22.92 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  22.22 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  24.24 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  22.33 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  31.54 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  30.87 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1430  modification methylase, HemK family  32.95 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000467016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  31.67 
 
 		 361 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  26.71 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  21.72 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  21.72 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  23.26 
 
 		 330 aa  52.8  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  25.85 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  23.08 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>