More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0603 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  472  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  97 
 
 
233 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  93.99 
 
 
233 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  47.39 
 
 
230 aa  229  3e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  46.9 
 
 
231 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  42.36 
 
 
237 aa  191  9e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  44.74 
 
 
235 aa  187  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  40 
 
 
233 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  41.36 
 
 
235 aa  176  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  38.39 
 
 
231 aa  161  9e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  29.82 
 
 
251 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  30.19 
 
 
247 aa  101  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  26.27 
 
 
268 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  24.29 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  24.29 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  27.88 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  27.31 
 
 
256 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  33.33 
 
 
222 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  24.27 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  28.31 
 
 
241 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  26.51 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  26.15 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.47 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  29 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  27.27 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  27.01 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  24.14 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  27.88 
 
 
266 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
260 aa  85.5  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  24.42 
 
 
249 aa  85.5  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  24.39 
 
 
252 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  25.56 
 
 
249 aa  85.1  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  27.04 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  26.61 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  23.11 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  24.42 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  24.42 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.42 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.42 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.42 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  23.96 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  23.96 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  26.91 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  25.32 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  24.12 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  23.79 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  23.3 
 
 
246 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  22.49 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  25.11 
 
 
257 aa  78.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  22.22 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  22.22 
 
 
241 aa  78.6  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  27.18 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  23.5 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  23.29 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  24.59 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  21.13 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  27.78 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.79 
 
 
240 aa  72  0.000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  22.49 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  22.17 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  23.98 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  21.7 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  22.37 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  22.28 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  28.81 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  20.86 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  22.84 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0272  O-methyltransferase-like protein  28.38 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  22.27 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  24.14 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  22.84 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  23.28 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  21.62 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  23.15 
 
 
254 aa  64.3  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  27.67 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  21.11 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.4 
 
 
365 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  22.41 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  24.65 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  19.68 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  22.68 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  21.67 
 
 
260 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  24.29 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  20.98 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  24.32 
 
 
228 aa  62  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  19.9 
 
 
240 aa  62  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  25.29 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  21.74 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  24.4 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.18 
 
 
342 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  20.4 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2551  methyltransferase small  31.97 
 
 
308 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.473932  normal  0.100873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2276  methyltransferase small  30.94 
 
 
312 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0384491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  23.48 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  34.18 
 
 
343 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  25.85 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.91 
 
 
343 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  25.84 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  32.91 
 
 
343 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>