183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2952 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  100 
 
 		 260 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  47.56 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  43.72 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  46.25 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  45.83 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  45.42 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  42.97 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  43.15 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  41.91 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  39.53 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  40.49 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  42.08 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  41.67 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  42.08 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  41.35 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  41.25 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  39.43 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  34.25 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  40.83 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  35.47 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  32.05 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  33.14 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  29.74 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  28.26 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  37.6 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  35.53 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  40.25 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  29.17 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  31.9 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  31.56 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  33.75 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  33.33 
 
 		 286 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  33.75 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  30.47 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  38.68 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  37.33 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  35.6 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  37.17 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  29.49 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  34.3 
 
 		 257 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  31.38 
 
 		 245 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  31.03 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25.1 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  39.75 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.33 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  27.24 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  29.61 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  26.92 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  30.46 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  22.27 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  26.45 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.28 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  30.45 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  27 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  24.58 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  25.22 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  25.22 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.57 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  23.72 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  25.96 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  23.18 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  25.59 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  25.12 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  27.59 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  27.16 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  27.16 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  27.16 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  26.75 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  24.32 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  26.91 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  26.75 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  26.75 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  26.75 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  26.75 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  26.75 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  26.75 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  32.44 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  25.62 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  33.9 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  33.03 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.15 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  20.26 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  26.16 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  22.98 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  25.96 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.55 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  21.07 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  32.91 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  22.33 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  31.62 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  27.2 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  32.48 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  27.71 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  31.54 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  29.26 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  23.45 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  22.47 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>