More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0705 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  100 
 
 
268 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  54.29 
 
 
249 aa  229  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  46.67 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  41.25 
 
 
398 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  35.85 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  36.79 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  36.45 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  37.55 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  32.57 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  31.94 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  37.32 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  38.39 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  38.14 
 
 
258 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  47.83 
 
 
438 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  35.48 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  36.36 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
256 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  30.14 
 
 
247 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  29.82 
 
 
249 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  35.47 
 
 
211 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  28.9 
 
 
249 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  24.56 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  35.94 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  27.06 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  32.11 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  28.97 
 
 
330 aa  97.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  31.42 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  31.84 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  29.77 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  29.68 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  29.22 
 
 
246 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  32.96 
 
 
216 aa  94  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  28.76 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  29.49 
 
 
241 aa  92  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  28.77 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  25.24 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  27.78 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  37.12 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  31.43 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  27.32 
 
 
228 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  28.77 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  28.77 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  28.77 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  28.77 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  28.77 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  28.7 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  29.55 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  28.7 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  23.87 
 
 
240 aa  89.4  6e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  24.44 
 
 
233 aa  89  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  28.31 
 
 
246 aa  89  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  28.77 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  28.77 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  31.34 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  23.56 
 
 
233 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  27.15 
 
 
231 aa  86.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  25.45 
 
 
230 aa  85.9  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
216 aa  85.5  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  27.68 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  31.45 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  35.03 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  23.11 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  26.13 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  32.04 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  26.51 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1571  hypothetical protein  29.21 
 
 
226 aa  79  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  25.94 
 
 
240 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  33.97 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  33.49 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  33.18 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  25.57 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  24.76 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  34.78 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  31.94 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1419  hypothetical protein  28.65 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  30.66 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  32.73 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  21.12 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  33.48 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  26.63 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  23.29 
 
 
338 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  25.12 
 
 
233 aa  72  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  33.01 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  25.38 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  37.14 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  34.75 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  21.72 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.86 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.97 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  44.87 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  32.23 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  30.21 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  30.84 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  28.67 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  33.04 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  40.78 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  38 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  42.86 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>