157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4352 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  100 
 
 		 253 aa  480  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  69.29 
 
 		 288 aa  291  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  68.53 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  64.09 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  68.55 
 
 		 265 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  68.57 
 
 		 261 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  65.45 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  50 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  51.84 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  49.38 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  47.74 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  48.15 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  44.31 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  45.93 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  44.4 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  43.1 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  42.98 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  45.45 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  45.82 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  39.15 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  39.57 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  41.67 
 
 		 286 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  42.31 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  48.79 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  44.78 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  40.35 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  42.17 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  43.53 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  43.83 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  43.65 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  40.62 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  43.62 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  45.08 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  40.34 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  40.34 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  32.63 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  40.17 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  33.87 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  31.58 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  39.59 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  34.42 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  33.8 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  26.52 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  35.68 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  30.74 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  27.31 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  31.09 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  29.96 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  30.89 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  31.25 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  28.64 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  28.14 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  30 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  29.83 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  22.52 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  24.66 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  26.91 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  26.91 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  23.96 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  24.66 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  24.2 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  26.54 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  24.4 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.04 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  27.66 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  29.58 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  26.64 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.58 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  28.39 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  22.99 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  28.77 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.36 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  25.24 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  24.89 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  27.16 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25.71 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  23.11 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  29.46 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  25.82 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  27.98 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  26.61 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  23.87 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.71 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  24.18 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.71 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0651  methyltransferase related protein  30.61 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  25.31 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  25.31 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  25.31 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  24.9 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  24.9 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  29.63 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  25.31 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  24.9 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  24 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  31.45 
 
 		 343 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>