136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3214 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  81.45 
 
 		 261 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  65.74 
 
 		 259 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  68.2 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  69.29 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  64.02 
 
 		 257 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  65.27 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  50.63 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  50.43 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  50.43 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  49.15 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  50.6 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  39.15 
 
 		 260 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  47.48 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  43.84 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  47.33 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  40.08 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  42.86 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  36.84 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  39.11 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  51.32 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  37.78 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  36.21 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  44.3 
 
 		 256 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  43.04 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  41.77 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  41.77 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  44.3 
 
 		 258 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  39.74 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  43.87 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  40.73 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  41.22 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  37.05 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  37.87 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  42.24 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  41.89 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  29.06 
 
 		 248 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  32.61 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  27.16 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  30.89 
 
 		 245 aa  92.4  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  31.08 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  32.46 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  28.57 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  29.57 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  37.17 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  26.36 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  32.41 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  28.09 
 
 		 241 aa  85.9  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  30.74 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  30.87 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  29.06 
 
 		 237 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  27.31 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  27.31 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  24.35 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  30 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.32 
 
 		 268 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  24.07 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  33.19 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  27.82 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  27.82 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  27.82 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  26.58 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  27.42 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  27.42 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  29.29 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  26.05 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  28.79 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  27.42 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  26.23 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.56 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  27.42 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  27.42 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  28.02 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  30.77 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.95 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  27.23 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  25.43 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  31.22 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  26.61 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  25.9 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  27.4 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  26.59 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.46 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  24.66 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  26.59 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  24.77 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  25.32 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  23.32 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_92293  predicted protein  30.5 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  26.11 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  23.89 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  24.42 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  25.71 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.59 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  32.81 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  23.86 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>