185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0724 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  44.88 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  44.62 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  46.09 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  45.65 
 
 		 253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  42.23 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  42.97 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  40.55 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  43.1 
 
 		 252 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  42.91 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  41.22 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  43.72 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  41 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  41 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  40.33 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  44.81 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  41.83 
 
 		 261 aa  148  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  39.15 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  43.75 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  38.91 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  38.82 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  39.53 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  44.13 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  38.43 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  39.13 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  44.31 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  36.96 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  40.41 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  35.63 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  37.45 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  44.98 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  35.6 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  35.6 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  42.45 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  35.78 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  38.63 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  32.51 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  34.65 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  31.95 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25.79 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  33.48 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  30.67 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  30.54 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  30.13 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  29.39 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  29.72 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  32.11 
 
 		 268 aa  96.7  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  28.28 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  28.86 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  28.69 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  28.69 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  28.28 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  28.28 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  31.91 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  28.28 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  28.28 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  27.87 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  27.87 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  27.46 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  25.32 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  28.74 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.75 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  28.96 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  26.23 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  27.57 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  26.45 
 
 		 338 aa  85.5  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  26.64 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  26.42 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  28.69 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  22.67 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  25.2 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  24.49 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  27.53 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.78 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  22.92 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  25.23 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  25.41 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  28.97 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  23.87 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  21.52 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  22.08 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  22.08 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  27.62 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  27.6 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  21.52 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  23.11 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  30.95 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  30.95 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  30.95 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  20.63 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  22.16 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  25.62 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  19.28 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  28.87 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  28.17 
 
 		 245 aa  62  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  28.71 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  27.46 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  27.46 
 
 		 245 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>