191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2351 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  490  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  65.74 
 
 
259 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  69.88 
 
 
265 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  63.52 
 
 
288 aa  275  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  66.02 
 
 
259 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  64.63 
 
 
261 aa  265  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  65.45 
 
 
253 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  51.09 
 
 
250 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  50.2 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  49.34 
 
 
250 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  48.46 
 
 
250 aa  174  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  43.75 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  47.39 
 
 
252 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  40.27 
 
 
271 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  41.15 
 
 
253 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  42.79 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  41.15 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  41.28 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  38.39 
 
 
262 aa  135  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  41.94 
 
 
257 aa  135  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  38.43 
 
 
239 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  48.18 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  43.85 
 
 
245 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  37.5 
 
 
263 aa  119  6e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  39.11 
 
 
247 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  46.88 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  40.79 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  34.82 
 
 
241 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  40 
 
 
256 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  39.48 
 
 
286 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  40.61 
 
 
242 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  40.43 
 
 
258 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  38.08 
 
 
258 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  37.66 
 
 
264 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  35.75 
 
 
249 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  37.05 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  36.12 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  36.12 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  36.47 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  33.18 
 
 
256 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  33.47 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  24.77 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  25.81 
 
 
233 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
216 aa  85.5  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  32.24 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  27.43 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  33.8 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  26.64 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  34.09 
 
 
268 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  30.52 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  33.51 
 
 
254 aa  82  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.33 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  24.88 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  30.83 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  29.58 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  27.66 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  25.31 
 
 
246 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  29.78 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  29.57 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  24.55 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  24.42 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.65 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  21.92 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  33.5 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  21.16 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  24.77 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  25.78 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  23.63 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  26.99 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  24.77 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  27.93 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  24.42 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.48 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  26.75 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  23.53 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  26.07 
 
 
240 aa  67  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  27.8 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  25.71 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  26.64 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  26.64 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  25.31 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  22.52 
 
 
231 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25.79 
 
 
243 aa  62.4  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_92293  predicted protein  29.62 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.31 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  22.61 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.31 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.9 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.9 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.9 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  26.32 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  24.9 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  26.63 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  24.49 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  24.49 
 
 
246 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  23.83 
 
 
228 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  25.22 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>