More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1113 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  100 
 
 		 257 aa  494  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  50.58 
 
 		 258 aa  218  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  45.93 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  46.59 
 
 		 250 aa  182  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  45.71 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  46.69 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  48 
 
 		 249 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  48.8 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  38.91 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  47.48 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  43.6 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.11 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  39.52 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  38.91 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  43.15 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  45.93 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  44 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  44 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  40.08 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  44.67 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  39.53 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  38.96 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  45.34 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  42.24 
 
 		 259 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  45.16 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  45.02 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  42.26 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  35.71 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  37.19 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  40 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  39.11 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  35.48 
 
 		 239 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  40 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  42.24 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  42.42 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  38.25 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  36.6 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  33.19 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  24.9 
 
 		 230 aa  95.5  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  35.71 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  30.67 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  37.7 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  27.23 
 
 		 237 aa  85.9  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  25.11 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  24.68 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  28.86 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  24.68 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  32.92 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.61 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  29.32 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  30.74 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  29.83 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  29.41 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  23.63 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  25 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.29 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  28.45 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  30.28 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  25.34 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  24.59 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  30.28 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  23.77 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  25 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  26.02 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  22.36 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  24 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.05 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  22.86 
 
 		 330 aa  65.5  0.0000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  24.8 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  23.81 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  23.81 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  24.39 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  24.9 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  24.08 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  24.47 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  32.81 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  23.48 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  32.81 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  20.99 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  24.89 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  31.41 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  23.33 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  24.49 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.49 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.49 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.83 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  24.49 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.49 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  27.52 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  29.61 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  34.95 
 
 		 326 aa  62  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  25.11 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  26.97 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  23.36 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  20 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  24.08 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  33.02 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  28.37 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>