173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1434 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  100 
 
 		 239 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  50.41 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  41.22 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  45.49 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  45.49 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  43.8 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  39.84 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  40.73 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  41.56 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  41.91 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  40.85 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  37.96 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  39.74 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  38.26 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  42.51 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  36.84 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  36.48 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  36.99 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  36.6 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  40.35 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  37.12 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  35.48 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  35.19 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  38.43 
 
 		 265 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  35.02 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  30.36 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  39.84 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  37.02 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  33.82 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  29.91 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  30.67 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  30.4 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  32.58 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  29.07 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  29.07 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  30.66 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.86 
 
 		 268 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  28.7 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  28.1 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  31.36 
 
 		 286 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.18 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  29.77 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  31.98 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  27.31 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  21.62 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  31.22 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  29.95 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  30.99 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  21.94 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  36.4 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  20.93 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  25.86 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  29.86 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  25.55 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  21.17 
 
 		 233 aa  62  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  24.77 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  25.21 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  20.18 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  24.41 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  26.43 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  23.77 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  28.25 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  25.76 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  19.91 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  31.97 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  21.92 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1535  modification methylase, HemK family  30.82 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0187998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  34.04 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  24.58 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  25.22 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  23.87 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  18.64 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  34.71 
 
 		 438 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  23.89 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  34.44 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  23.66 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.99 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  22.81 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  24.5 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  32.17 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  23.03 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  35.23 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2355  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  36.67 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  22.97 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.13 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  33.59 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4816  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyl transferase  36.23 
 
 		 422 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  21.5 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1889  O-methyltransferase  36.36 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  23.21 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  23.08 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0325  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  31.25 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.109217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  31.85 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  37.33 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  31.19 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  29.17 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5100  hypothetical protein  28.1 
 
 		 315 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  32.39 
 
 		 449 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  23.45 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>