115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0053 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  100 
 
 		 272 aa  540  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  50.41 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  41.43 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  38.43 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.84 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  39.44 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  38.02 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  34.36 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  36.65 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  34.25 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  30.33 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  35.32 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  33.59 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  29 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  27.66 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  33.87 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  33.06 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  25 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  32.14 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  32.82 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  30.74 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  30.83 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  33.2 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  30.58 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  32.92 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  31.06 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  30.24 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.15 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  33.51 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  35.92 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  34.45 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  26.41 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  18.22 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  27.75 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  26.79 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  22.13 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  20.96 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  20.27 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  26.87 
 
 		 263 aa  57  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  28.76 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  23.53 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  24.05 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  21.67 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  26.41 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  23.31 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  30.45 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  28.02 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  23.58 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  30.2 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  25.47 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  21.67 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  22.5 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  22.12 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  22.12 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  26.01 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  18.8 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  22.12 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  22.08 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  19.11 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  22.5 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  21.68 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  22.03 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  21.68 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  21.68 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  25.85 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  21.24 
 
 		 246 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  27.27 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  21.49 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  23.75 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  23.75 
 
 		 238 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  23.74 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  23.18 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  24.17 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  29.39 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  26.6 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  19.46 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  26.24 
 
 		 353 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  31.78 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  33.67 
 
 		 535 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  27.48 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  24.55 
 
 		 236 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  30.82 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  17.36 
 
 		 247 aa  46.2  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  22.71 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  26.67 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  26.56 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  26.24 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  37.37 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  24.55 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  23.33 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  25.9 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  26.44 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.84 
 
 		 402 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  26.44 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  28.57 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0687  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  25.53 
 
 		 353 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3335  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  25.53 
 
 		 353 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.533815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>