212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3652 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  29.61 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 229 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  37.45 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  34.91 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  31.96 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  28.33 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  34.32 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  36.69 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  36.69 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 228 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  34.35 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  33.62 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  36.29 
 
 		 234 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  34.6 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  34.82 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  34.51 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  36.03 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  35.63 
 
 		 237 aa  95.1  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  35.22 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  30.8 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  28.7 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  33.77 
 
 		 223 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  33.5 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  30.41 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  34.98 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.21 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  30.17 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  27.43 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  22.36 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  23.24 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2232  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.74 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.618001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  28.15 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19651  hypothetical protein  22.98 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0644174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  26.56 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  22.54 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  21.49 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  37.35 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  20.08 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  31.15 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  28.76 
 
 		 2012 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04910  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.09 
 
 		 386 aa  52.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  26.88 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.26 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  20.08 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  23.5 
 
 		 242 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 337 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  19.49 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0729  putative methyltransferase  32.82 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0628  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  20.18 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  34.32 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  19.67 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  34.32 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  22.41 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  25 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  21.03 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  27.22 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  25.64 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.65 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.47 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  22.61 
 
 		 245 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  24.39 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  37.93 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.15 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.89 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 266 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  35.38 
 
 		 349 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0857  S-adenosylmethionine-diacylgycerolhomoserine-N- methlytransferase  34.17 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  39.66 
 
 		 335 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1727  methyltransferase type 12  32.61 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  35.44 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  29.53 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  29.31 
 
 		 1372 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  34.78 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.96 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 270 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  31.72 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2111  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 224 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1549  methyltransferase type 12  20.61 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0797  Methyltransferase type 12  30.25 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>