190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1060 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  59.29 
 
 
248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  59.84 
 
 
248 aa  291  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  61.07 
 
 
248 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  53.25 
 
 
248 aa  259  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  53.25 
 
 
248 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  52.85 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  53.94 
 
 
260 aa  251  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  50.8 
 
 
245 aa  248  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  51.2 
 
 
245 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50.8 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  50.8 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  50.8 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  50.8 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  51.2 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  50.8 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  50.8 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  53.47 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  41.15 
 
 
236 aa  199  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  38.91 
 
 
239 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  39.2 
 
 
240 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  41.56 
 
 
243 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  38.46 
 
 
239 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  37.92 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  38.91 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  36.88 
 
 
263 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  37.12 
 
 
264 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  39.26 
 
 
241 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  35.34 
 
 
265 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  38.43 
 
 
238 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  40.08 
 
 
236 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  36.67 
 
 
235 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  40.08 
 
 
236 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  34.3 
 
 
236 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  34.8 
 
 
251 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  35.95 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  40.09 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  38.67 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  35 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  36.67 
 
 
238 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  36.67 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  33.2 
 
 
240 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  35.39 
 
 
244 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  35.83 
 
 
238 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  35.83 
 
 
238 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  37.6 
 
 
247 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  35.34 
 
 
248 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  35.92 
 
 
243 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  31.97 
 
 
234 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  31.89 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  37.45 
 
 
255 aa  118  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  29.7 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  23.96 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  24.54 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  26.86 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  31.1 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.71 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.35 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  28.71 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  28.17 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  27.16 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  28.63 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  26.48 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  29.19 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  26.04 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  30.92 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  24.04 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  19.91 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  27.63 
 
 
256 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  28.19 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  25.62 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  28.16 
 
 
271 aa  62.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  28.36 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  25 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  25.32 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  24.5 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  24.29 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  22.57 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  28.89 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  23.44 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  26.07 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  23.56 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  25.45 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  30.34 
 
 
245 aa  55.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  21.47 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  25.14 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  33.86 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  33.86 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  21.5 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  21.5 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  27.21 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  28.24 
 
 
228 aa  53.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2470  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.8 
 
 
294 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112991  hitchhiker  0.0000511944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  29.61 
 
 
252 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  20.64 
 
 
246 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  25.93 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  22.37 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  21.1 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1667  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.76 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0189322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>