More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1949 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  100 
 
 
237 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  60.26 
 
 
235 aa  276  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  52.36 
 
 
231 aa  249  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  50.87 
 
 
233 aa  211  7e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  46.15 
 
 
235 aa  207  8e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  41.48 
 
 
230 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  42.36 
 
 
233 aa  191  6e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  42.36 
 
 
233 aa  191  9e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  42.36 
 
 
233 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  41.05 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  31.17 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  32.17 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  30.7 
 
 
256 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  31 
 
 
266 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  29.87 
 
 
258 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  28.7 
 
 
249 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  29.15 
 
 
247 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  29.11 
 
 
248 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  31.56 
 
 
249 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  30.87 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  30.13 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  26.89 
 
 
251 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.96 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  27.56 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  26.61 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  26.61 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  26.61 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 
260 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  27.27 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  26.18 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  26.18 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  26.18 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  25.75 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  25.75 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  25.75 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  25.32 
 
 
246 aa  90.1  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  26.5 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  27.27 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  31.34 
 
 
268 aa  88.6  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  25.75 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  27.2 
 
 
254 aa  88.2  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  29.13 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  28.9 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  27.69 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  26.18 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  30.54 
 
 
250 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.99 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  30.64 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  28.57 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  25.55 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  26.23 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  26.84 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  26.81 
 
 
257 aa  81.6  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  23.5 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  30.42 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  27.43 
 
 
252 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  29.38 
 
 
275 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  24.24 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.33 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  28 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  27.54 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  26.79 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  26.41 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  23.71 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  25 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  23.71 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  29.95 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  44.71 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61220  hypothetical protein  43.43 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.527408  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  43.33 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.33 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  43.33 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0840  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.83 
 
 
347 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  45.88 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3507  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.83 
 
 
347 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3636  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  38.83 
 
 
347 aa  68.6  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  40 
 
 
332 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  45.88 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  43.33 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  43.33 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  45.88 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.76 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  26.18 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  45.88 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  41.94 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  45.88 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  38.28 
 
 
333 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.02 
 
 
332 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  25.67 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  26.94 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  45.88 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  43.02 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  35.71 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  34.88 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  29.06 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25.25 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  28.76 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  41.86 
 
 
332 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  42.22 
 
 
343 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>