More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1127 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  100 
 
 
248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  99.19 
 
 
252 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  60.64 
 
 
260 aa  308  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  54.88 
 
 
248 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  55.28 
 
 
248 aa  265  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  53.25 
 
 
265 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  51.87 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  51.87 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  51.87 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  51.87 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  51.87 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  51.87 
 
 
245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  51.87 
 
 
245 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  51.87 
 
 
245 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  51.87 
 
 
245 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  49.79 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  53.53 
 
 
245 aa  252  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  45.49 
 
 
236 aa  205  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  43.46 
 
 
239 aa  199  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  40.66 
 
 
239 aa  185  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  38.89 
 
 
235 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  39.48 
 
 
240 aa  176  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  39.83 
 
 
240 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  40.85 
 
 
234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  41.28 
 
 
215 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  39.26 
 
 
243 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  36.1 
 
 
240 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  36.29 
 
 
251 aa  158  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  35.36 
 
 
263 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  36.48 
 
 
243 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  38.91 
 
 
238 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  35.36 
 
 
265 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  34.29 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  37.55 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  37.13 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  34.19 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  35.42 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  34.22 
 
 
264 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  35.98 
 
 
238 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  32.28 
 
 
253 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  35.56 
 
 
238 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  38.3 
 
 
247 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  35.15 
 
 
238 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  35.15 
 
 
238 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  36.1 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  34.16 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  36.29 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  36.2 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  32.63 
 
 
234 aa  129  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  35.95 
 
 
255 aa  126  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  29.96 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25.82 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.78 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  28.38 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  28.33 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0352  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  34.62 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.576834  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0173  ribosomal protein L3 N-methyltransferase  34.62 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18041  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  27.7 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.23 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  27.57 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  27.7 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  30.88 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  27.35 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.83 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  27.46 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  27.71 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  26.88 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  30.84 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  25.35 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  31.15 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  25.76 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  30.95 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  28.87 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1657  modification methylase,HemK family  34.97 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  25.88 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0905  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.5 
 
 
367 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  30 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  23.94 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  29.37 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  29.37 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  29.37 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  40.74 
 
 
341 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  29.57 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  25.61 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  29.37 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  29.37 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  22.6 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  30.07 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0889  HemK family modification methylase  41.3 
 
 
284 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.142324  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  26.67 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.96 
 
 
322 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290755  normal  0.149548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  28.67 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  24.82 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  28.67 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.51 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>