More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0637 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  519  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  70.71 
 
 
255 aa  346  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  64.14 
 
 
256 aa  297  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  61.3 
 
 
258 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  63.04 
 
 
266 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  52.92 
 
 
245 aa  255  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  55.08 
 
 
268 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  43.9 
 
 
249 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  38.59 
 
 
251 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  35.15 
 
 
260 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  35.9 
 
 
248 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  32.49 
 
 
251 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  37.13 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  33.47 
 
 
256 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  35.02 
 
 
249 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  32.48 
 
 
241 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  34.29 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  34.29 
 
 
246 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  32.11 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  34.16 
 
 
246 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  34.69 
 
 
246 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  34.16 
 
 
246 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  33.74 
 
 
246 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  33.74 
 
 
246 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  33.74 
 
 
246 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  33.74 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  33.74 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  30.8 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  29.54 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  33.6 
 
 
246 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  29.54 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  31.28 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  30.43 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  31.25 
 
 
246 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  36.76 
 
 
211 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  31.58 
 
 
247 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  30.34 
 
 
241 aa  122  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  29.83 
 
 
240 aa  122  5e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  31.69 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  31.94 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  38.14 
 
 
268 aa  119  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  28.94 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  28.94 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  28.38 
 
 
330 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  35.89 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  29.11 
 
 
228 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  28.97 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
248 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  29.87 
 
 
237 aa  105  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  27.27 
 
 
338 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  30.09 
 
 
235 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.02 
 
 
253 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  27.63 
 
 
231 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  32.11 
 
 
253 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  29.72 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  29.36 
 
 
222 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  27.91 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  26.89 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  26.15 
 
 
233 aa  92.4  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  27.06 
 
 
233 aa  92  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  29.55 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  26.36 
 
 
237 aa  90.1  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  29.32 
 
 
271 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  25.33 
 
 
235 aa  89.7  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  32.91 
 
 
247 aa  89  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  31.2 
 
 
275 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  30.84 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  30.64 
 
 
398 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  30.04 
 
 
250 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  26.94 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  30.04 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  26.78 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  29.75 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  31.28 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  40.77 
 
 
438 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  24.09 
 
 
231 aa  82  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  28.37 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  30.8 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  32.61 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  27.08 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  31.25 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  29.68 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.36 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  28.38 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  28.38 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  28.38 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  24.69 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  27.66 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  30.33 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  29.27 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.27 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  29.27 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  29.27 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  29.27 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  29.27 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  29.27 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  29.27 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  30.2 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>