166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1090 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  100 
 
 		 265 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  79.28 
 
 		 259 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  69.6 
 
 		 259 aa  317  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  68.55 
 
 		 253 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  70.33 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  65.27 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  62.24 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  51.74 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  47.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  47.28 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  41.22 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  48.77 
 
 		 256 aa  165  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  45.68 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  43.53 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  43.48 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  43.91 
 
 		 253 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  46 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  45.16 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  40.89 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  44.53 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  39.65 
 
 		 239 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 256 aa  128  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  39.37 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  48.59 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  39.6 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  38.77 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  43.67 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  38.63 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  37.82 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  37.89 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  34.45 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  32.91 
 
 		 241 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  39.62 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  37.5 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  42.48 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  38.46 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  38.46 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  38.14 
 
 		 242 aa  98.6  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  35.92 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  33.77 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  33.66 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  27.03 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  27.78 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  31.48 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  35.12 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  31.11 
 
 		 245 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  27.63 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  31.22 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  31.41 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  27.19 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.96 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.14 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  23.32 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  30.59 
 
 		 258 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  30 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  26.01 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  26.01 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  25.84 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  25.36 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  26.57 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  28.83 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  28.93 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  25.12 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  26.09 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  30.59 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  20.92 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.63 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  28.83 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  24.32 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  23.08 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  23.5 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  25.12 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_92293  predicted protein  30.35 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3235  HemK related protein  28.33 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0543082  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  24.9 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1890  methylase of polypeptide chain release factor  28.15 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3515  methyltransferase family protein  24.43 
 
 		 378 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000598825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  23.75 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3411  methyltransferase family protein  24.43 
 
 		 378 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  25.79 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3481  methyltransferase family protein  24.43 
 
 		 378 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3407  methyltransferase family protein  24.43 
 
 		 378 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  30.77 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  23.88 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3577  methyltransferase family protein  23.86 
 
 		 378 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.227162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4912  methyltransferase small  32.81 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  0.023747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  32.26 
 
 		 288 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  25.85 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  27.74 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  29.23 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0822  modification methylase, HemK family  30.82 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>