283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3299 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  100 
 
 
250 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  87.95 
 
 
250 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  87.55 
 
 
250 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  67.06 
 
 
252 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  65.57 
 
 
249 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  70.78 
 
 
250 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  45.93 
 
 
257 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  47.7 
 
 
259 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  49.15 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  49.57 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  41 
 
 
260 aa  155  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  46.83 
 
 
258 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  48.46 
 
 
259 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  47.46 
 
 
257 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  47.74 
 
 
253 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  45.87 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  37.45 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  37.15 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  37.15 
 
 
252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  39.51 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  46.86 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  41.7 
 
 
245 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  40 
 
 
256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  39.32 
 
 
242 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  36.72 
 
 
258 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  39.04 
 
 
253 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  39.04 
 
 
253 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  38.65 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  40.18 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  37.86 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  34.82 
 
 
256 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  41.67 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  34.18 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  35.04 
 
 
262 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  33.62 
 
 
245 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  36.48 
 
 
239 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  39.11 
 
 
256 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  29.46 
 
 
248 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  27.93 
 
 
251 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  26.19 
 
 
330 aa  99.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  39.02 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  31.28 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  29.79 
 
 
256 aa  88.6  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  32.58 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  35.11 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25.97 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  29.82 
 
 
254 aa  86.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  30.96 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  30.04 
 
 
258 aa  85.1  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  34.8 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  31.33 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  27.51 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  26.73 
 
 
240 aa  82  0.000000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  31.63 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  28.7 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  25.33 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  28.03 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  30.42 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  27.27 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  25.31 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.86 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  25.5 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  33.48 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  29.17 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  27.01 
 
 
240 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  22.82 
 
 
231 aa  72  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  24.79 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  28.57 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  25.53 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  22.84 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.43 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  30.24 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  25.2 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  23.28 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  23.28 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  20.56 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  24.39 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  22.84 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  24.68 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  28.67 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  24.8 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  24.8 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  22.27 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  24.39 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  24.39 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  24.39 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  24.6 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  24.39 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  24.9 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3281  O-methyltransferase-like protein  34.36 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180863  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  23.5 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  25.21 
 
 
338 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  24.35 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  38.71 
 
 
335 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  21.78 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  31.58 
 
 
398 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>