42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0665 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0665  methyltransferase small  100 
 
 		 271 aa  555  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.29 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  31.47 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.81 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  29.08 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  27.22 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07230  methylase of polypeptide chain release factors  27.06 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.242391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5015  methyltransferase small  32.58 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.241012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  29.93 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  26.63 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  33.33 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1723  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  28.24 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  31.03 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  24.64 
 
 		 279 aa  45.4  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1642  HemK family modification methylase  25.45 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  34.85 
 
 		 439 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1594  ribosomal L11 methyltransferase  27.63 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.77497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  28.05 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0157  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1555  methyltransferase small  28.87 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0273  16S RNA G1207 methylase RsmC  28.35 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1173  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.9 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.404296  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  26.01 
 
 		 299 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1277  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.34 
 
 		 330 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0649  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  23.57 
 
 		 347 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  25.63 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  27.5 
 
 		 287 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  27.67 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  28.36 
 
 		 418 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1419  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.62 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000710273  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  24.83 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1896  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.21 
 
 		 297 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  25 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0948  peptide release factor glutamine N(5)-methylase  22.58 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  27.05 
 
 		 295 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.93 
 
 		 316 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1854  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  25.95 
 
 		 302 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  28.07 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  31.03 
 
 		 241 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02120  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  39.71 
 
 		 543 aa  42  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>