271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0021 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  100 
 
 
481 aa  997    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.2 
 
 
309 aa  127  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  30.74 
 
 
258 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  28.4 
 
 
281 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  28.46 
 
 
292 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  29.84 
 
 
305 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.21 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.07 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  26.77 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.58 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.58 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.31 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50.72 
 
 
293 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.77 
 
 
315 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1172  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.09 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  26.67 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.22 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  40.48 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2419  hypothetical protein  23.48 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.61 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  54.39 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.96 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.61 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  40.32 
 
 
239 aa  66.6  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  22.61 
 
 
259 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.04 
 
 
329 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.77 
 
 
274 aa  64.3  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.62 
 
 
276 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.62 
 
 
330 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.78 
 
 
313 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.06 
 
 
267 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  33.7 
 
 
287 aa  63.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.78 
 
 
256 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.08 
 
 
319 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.78 
 
 
311 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.8 
 
 
353 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.66 
 
 
257 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  30.15 
 
 
227 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0132  putative methylase  46.77 
 
 
225 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000100441 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.78 
 
 
284 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  42.86 
 
 
378 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  30.15 
 
 
227 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.74 
 
 
372 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  35.06 
 
 
285 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  30.15 
 
 
227 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  42.86 
 
 
378 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.09 
 
 
429 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0951  DNA methylase  33.73 
 
 
250 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.32 
 
 
334 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.26 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.95 
 
 
416 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2608  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.24 
 
 
265 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000327193 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.67 
 
 
222 aa  58.5  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  29.41 
 
 
227 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  23.87 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.13 
 
 
597 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.46 
 
 
350 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
271 aa  58.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.5 
 
 
276 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.58 
 
 
255 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  41.67 
 
 
416 aa  58.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.77 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.77 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  41.94 
 
 
413 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.24 
 
 
371 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3340  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
347 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000107199  hitchhiker  0.000000355353 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  36.36 
 
 
312 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0550  site-specific DNA-methyltransferase, putative  36.36 
 
 
250 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.20676  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1421  site-specific DNA-methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.85 
 
 
323 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.93 
 
 
391 aa  56.6  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.34 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.03 
 
 
308 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1626  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.77 
 
 
284 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  37.84 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.75 
 
 
292 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  30.77 
 
 
311 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.27 
 
 
327 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.76 
 
 
225 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.55 
 
 
446 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.76 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0088  putative DNA methylase protein  25.27 
 
 
217 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.346919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
283 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.09 
 
 
372 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.65 
 
 
296 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  37.65 
 
 
540 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.02 
 
 
368 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1402  DNA modification methylase-like  35.48 
 
 
264 aa  53.9  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  32.47 
 
 
309 aa  53.9  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.55 
 
 
322 aa  53.9  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  43.06 
 
 
411 aa  53.9  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.87 
 
 
282 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.03 
 
 
369 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04295  hypothetical protein  44.44 
 
 
377 aa  53.5  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  45.1 
 
 
483 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.36 
 
 
396 aa  53.5  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>