48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0088 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0088  putative DNA methylase protein  100 
 
 		 217 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.46 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  27.45 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  25.27 
 
 		 481 aa  55.1  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.15 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.6 
 
 		 372 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.66 
 
 		 309 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.04 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.66 
 
 		 334 aa  46.2  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.44 
 
 		 293 aa  45.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.66 
 
 		 315 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.38 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.66 
 
 		 372 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  29.38 
 
 		 292 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.93 
 
 		 395 aa  45.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  24.87 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.38 
 
 		 597 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.62 
 
 		 412 aa  45.1  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.48 
 
 		 471 aa  45.1  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.73 
 
 		 441 aa  44.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 		 483 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  20.94 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.91 
 
 		 416 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.66 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.93 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.68 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  27.94 
 
 		 350 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2300  DNA methylase N-4/N-6  40.43 
 
 		 287 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.82 
 
 		 358 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  27.94 
 
 		 351 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3838  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.35 
 
 		 311 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  25.75 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 		 398 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0864  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.41 
 
 		 299 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2419  hypothetical protein  29.82 
 
 		 361 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  28.41 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.72 
 
 		 323 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.73 
 
 		 370 aa  42  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.12 
 
 		 255 aa  41.6  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.29 
 
 		 225 aa  42  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.48 
 
 		 488 aa  41.6  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  23.23 
 
 		 307 aa  41.6  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  35.59 
 
 		 378 aa  41.6  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  27.21 
 
 		 350 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  40.35 
 
 		 266 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.9 
 
 		 329 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>