197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2184 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
371 aa  765    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.69 
 
 
375 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  58.28 
 
 
372 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.17 
 
 
372 aa  348  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.1 
 
 
353 aa  347  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.55 
 
 
368 aa  340  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  54.05 
 
 
257 aa  289  6e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  33.71 
 
 
329 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  30.4 
 
 
259 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  32.51 
 
 
259 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  30.08 
 
 
249 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  26.24 
 
 
281 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1590  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.48 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.3 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  29.35 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  27.35 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  24.72 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  25.1 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.22 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  33.08 
 
 
459 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.35 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.35 
 
 
308 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  24.55 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0088  putative DNA methylase protein  26.46 
 
 
217 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.346919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.14 
 
 
947 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.2 
 
 
416 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.33 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.96 
 
 
302 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  35.37 
 
 
483 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  26.61 
 
 
413 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  24.24 
 
 
481 aa  56.6  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.1 
 
 
222 aa  57  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.15 
 
 
416 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  37.5 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.43 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  33.33 
 
 
407 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.28 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  22.26 
 
 
535 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.03 
 
 
441 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  37.5 
 
 
410 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  45.61 
 
 
270 aa  52.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  28.86 
 
 
495 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.1 
 
 
276 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.75 
 
 
597 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.27 
 
 
359 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
524 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  39.13 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  39.13 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.45 
 
 
273 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  40.68 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  28.66 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  34.21 
 
 
596 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.76 
 
 
293 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2487  hypothetical protein  27.85 
 
 
328 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  39.29 
 
 
450 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.33 
 
 
398 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 
301 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  50 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.53 
 
 
293 aa  50.1  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.7 
 
 
528 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  38.24 
 
 
330 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  51.22 
 
 
372 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.62 
 
 
483 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.03 
 
 
256 aa  49.7  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  41.07 
 
 
315 aa  49.7  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  30.1 
 
 
530 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 
305 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  30.68 
 
 
393 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.27 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.28 
 
 
273 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.27 
 
 
380 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.51 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  35.82 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.64 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.34 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.84 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.82 
 
 
239 aa  48.1  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  44.64 
 
 
540 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.11 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  38.98 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.19 
 
 
274 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.18 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  34.72 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0525  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.43 
 
 
284 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  38.18 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  34.62 
 
 
438 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0505  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 
239 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  38.18 
 
 
377 aa  47.4  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  32.1 
 
 
373 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  45.65 
 
 
304 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.38 
 
 
292 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  41.51 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  45.71 
 
 
436 aa  47  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.86 
 
 
225 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  29.76 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1172  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.7 
 
 
366 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  36 
 
 
377 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0965  DNA methylase N-4/N-6  35.85 
 
 
379 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>