145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6843 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  100 
 
 		 305 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  54.58 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  50.36 
 
 		 292 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8574  hypothetical protein  34.65 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0679954  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  29.84 
 
 		 481 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.25 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  25.73 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  27.88 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  24.42 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.1 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  30 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.53 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.44 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  29.26 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  23.63 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.68 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.7 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.8 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  23.88 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.13 
 
 		 597 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  47.92 
 
 		 463 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  32.98 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.66 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.44 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  26.11 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  46 
 
 		 416 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 369 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  35.29 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.37 
 
 		 330 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.21 
 
 		 421 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 488 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.21 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.48 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  40 
 
 		 266 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  29.09 
 
 		 350 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.93 
 
 		 425 aa  49.3  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.46 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.63 
 
 		 380 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.94 
 
 		 947 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  33.98 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.65 
 
 		 545 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.98 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  33.98 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.98 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  33.98 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.63 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  33.98 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.14 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  33.98 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  40.91 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  27.96 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.76 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  33.98 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  33.98 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  34.88 
 
 		 377 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.57 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3151  DNA methylase  39.13 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  hitchhiker  0.000000000119452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0880  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.14 
 
 		 753 aa  47  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.842424  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  25.23 
 
 		 367 aa  47  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.23 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1848  DNA methylase  39.13 
 
 		 352 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000193192  hitchhiker  0.0000000226376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.12 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.53 
 
 		 483 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.1 
 
 		 389 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.77 
 
 		 375 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  37.68 
 
 		 391 aa  46.6  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.12 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  28.18 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  30.53 
 
 		 421 aa  46.2  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.94 
 
 		 382 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2734  hypothetical protein  42.86 
 
 		 269 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  33.98 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.38 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  44.9 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.4 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  29.17 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.38 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.23 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.88 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  34.52 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2539  hypothetical protein  29.23 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.36 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1444  DNA methylase  43.08 
 
 		 349 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  23.24 
 
 		 535 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.35 
 
 		 849 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1044  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.89 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  40 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.76 
 
 		 377 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.1 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1272  DNA methylase  39.39 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.342929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.91 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.1 
 
 		 396 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1767  DNA methylase  37.88 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000189808  hitchhiker  0.00347478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.71 
 
 		 464 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.74 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.74 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.93 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.3 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>