179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1456 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  100 
 
 		 463 aa  949    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  27.65 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  27.32 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  26.61 
 
 		 483 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  28.37 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.4 
 
 		 947 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  22.84 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  23.37 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  26.36 
 
 		 495 aa  89.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  26.3 
 
 		 393 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  22.85 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  25.06 
 
 		 353 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.42 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  25.17 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.52 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.25 
 
 		 739 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  24.11 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  23.71 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  22.52 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  23.04 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  19.76 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  25.81 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  26.58 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  21.8 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  25.23 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  24.04 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  29.27 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  44.44 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.19 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  35.35 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  42.03 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  22.66 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  22.66 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  44.12 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  23.3 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  23.64 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.86 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  25.19 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  24.83 
 
 		 475 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.79 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.67 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  26.38 
 
 		 535 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  38.98 
 
 		 259 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.53 
 
 		 524 aa  54.3  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.36 
 
 		 279 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  22.73 
 
 		 614 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  37.29 
 
 		 329 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.96 
 
 		 372 aa  53.5  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  30.85 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.04 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  35 
 
 		 259 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.98 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  46.15 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.66 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.27 
 
 		 293 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  47.92 
 
 		 305 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.99 
 
 		 276 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.04 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0869  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.88 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.46 
 
 		 293 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  23.55 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  34.48 
 
 		 146 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  21 
 
 		 313 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  32.86 
 
 		 481 aa  50.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.88 
 
 		 391 aa  50.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.89 
 
 		 386 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0884  DNA methylase N-4/N-6  32.35 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.946324  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.53 
 
 		 633 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.97 
 
 		 276 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  46.55 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.62 
 
 		 375 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  37.1 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48 
 
 		 267 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.94 
 
 		 370 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.34 
 
 		 460 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  41.38 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.68 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.63 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  19.53 
 
 		 877 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6680  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.18 
 
 		 644 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000759129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0676  DNA methylase N-4/N-6  42.42 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.635951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  20.7 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.27 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.82 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.92 
 
 		 284 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.79 
 
 		 225 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.44 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  21.65 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.11 
 
 		 599 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  51.11 
 
 		 599 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  27.94 
 
 		 501 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.11 
 
 		 225 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  34.12 
 
 		 322 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.94 
 
 		 752 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36 
 
 		 222 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  28.28 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>