More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0845 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  81.48 
 
 		 421 aa  680    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  835    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  82.59 
 
 		 425 aa  690    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  76.43 
 
 		 421 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  47.96 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  48.09 
 
 		 409 aa  390  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  45.95 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  44.16 
 
 		 421 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  40.6 
 
 		 417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  40.19 
 
 		 448 aa  285  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  40.19 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  39.95 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  39.95 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  39.95 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.05 
 
 		 412 aa  282  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.9 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  39.55 
 
 		 411 aa  280  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  39.65 
 
 		 413 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.82 
 
 		 464 aa  279  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  39.34 
 
 		 411 aa  276  4e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  40.05 
 
 		 463 aa  276  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  40.96 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  41.2 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  67.16 
 
 		 222 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  38.62 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  40.44 
 
 		 435 aa  254  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.53 
 
 		 488 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  37.44 
 
 		 436 aa  229  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  34.98 
 
 		 470 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.45 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  35.4 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.63 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  31.19 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  38.8 
 
 		 684 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  54.05 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  52.78 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  68.55 
 
 		 247 aa  166  8e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_003296  RS06031  hypothetical protein  92.41 
 
 		 82 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7135  nuclease  53.15 
 
 		 183 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.782385  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  43.33 
 
 		 196 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  55.47 
 
 		 200 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  47.73 
 
 		 203 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1511  nuclease  41.98 
 
 		 178 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  44.29 
 
 		 169 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.57 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  51.52 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2933  ParB-like nuclease  52.34 
 
 		 177 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6991  ParB domain protein nuclease  45.65 
 
 		 184 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6266  ParB domain protein nuclease  43.26 
 
 		 212 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  43.7 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.43 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2279  ParB domain protein nuclease  51.85 
 
 		 87 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01351  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.739231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01340  conserved hypothetical protein  55.56 
 
 		 131 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0830  ParB domain protein nuclease  36.97 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00729707  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  39.66 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.52 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.39 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  29.91 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0599  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.75 
 
 		 94 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0661  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.75 
 
 		 94 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1319  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.22 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000125948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  26.3 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  44.16 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.99 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0705  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.592771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.35 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.16 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0040014  hitchhiker  0.000116244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  28.44 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.64 
 
 		 286 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.634742  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0124  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.98 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.46 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  26.27 
 
 		 294 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  25.19 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  42.47 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.46 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  25.19 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  25.19 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.11 
 
 		 243 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  25.19 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0821  haemagglutinin associated protein  29.23 
 
 		 230 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.893321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.13 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.97 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.86 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.78 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  25.19 
 
 		 294 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.81 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3531  putative methyltransferase  25.09 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1149  ParB domain protein nuclease  38.82 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0563  ParB domain protein nuclease  35.51 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0355  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.38 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3104  ParB domain protein nuclease  35.51 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  24.42 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2238  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.9 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000832138  hitchhiker  0.0000505476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  24.42 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.88 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.6 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1080  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25.36 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>