13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2539 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2734  hypothetical protein  76.84 
 
 		 269 aa  362  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1687  hypothetical protein  61.54 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00398874  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  31.58 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  31.37 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  38.54 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8574  hypothetical protein  34.19 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0679954  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  50 
 
 		 463 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.15 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  41.3 
 
 		 596 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.14 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  25.71 
 
 		 416 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.73 
 
 		 293 aa  42  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>