278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1658 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 
416 aa  838    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  38.24 
 
 
418 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  38.3 
 
 
412 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  34.34 
 
 
453 aa  224  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  36.74 
 
 
412 aa  210  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  31.85 
 
 
441 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  28.33 
 
 
417 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  27.65 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  25.6 
 
 
483 aa  123  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  25.06 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  27.75 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  26.37 
 
 
438 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.78 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.75 
 
 
947 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  23.81 
 
 
393 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  23.97 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  25 
 
 
430 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  23.7 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  25.18 
 
 
432 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  23.85 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  23.85 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  20.95 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.86 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  24.27 
 
 
464 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  25.89 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  22.7 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  24.05 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  24.84 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  24.44 
 
 
431 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.37 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.81 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  23.74 
 
 
425 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.43 
 
 
524 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.42 
 
 
739 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  30.82 
 
 
596 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.48 
 
 
633 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  23.15 
 
 
435 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  36.7 
 
 
535 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  36.67 
 
 
501 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  37.89 
 
 
146 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  41.76 
 
 
540 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  20.16 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.79 
 
 
528 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  25.26 
 
 
374 aa  60.1  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
276 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  20 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.71 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  23.02 
 
 
512 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  41.67 
 
 
481 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  26.32 
 
 
878 aa  57.4  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  34.57 
 
 
366 aa  57.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  22.83 
 
 
407 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  50 
 
 
292 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.54 
 
 
412 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  33.33 
 
 
461 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.16 
 
 
281 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.62 
 
 
279 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.17 
 
 
308 aa  57  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50.94 
 
 
315 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  44.64 
 
 
544 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.17 
 
 
308 aa  57  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  30.84 
 
 
877 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.39 
 
 
599 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  35.24 
 
 
530 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  39.39 
 
 
599 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  24.34 
 
 
450 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  46 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.03 
 
 
849 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.15 
 
 
334 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50.94 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  57.5 
 
 
372 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.06 
 
 
292 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.51 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  24.67 
 
 
614 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.89 
 
 
292 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.34 
 
 
356 aa  53.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.15 
 
 
267 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.47 
 
 
416 aa  53.1  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46 
 
 
471 aa  53.1  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40 
 
 
391 aa  53.1  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 
293 aa  53.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.59 
 
 
395 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  42.31 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.79 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  45.16 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.17 
 
 
293 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.28 
 
 
601 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0735  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48 
 
 
330 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.833245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2607  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.29 
 
 
237 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000328335 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0013  putative methylase  44.44 
 
 
227 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0043  putative methylase  44.44 
 
 
227 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.181539  normal  0.0471117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.23 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  34.18 
 
 
852 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0050  putative methylase  44.44 
 
 
227 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000518664  normal  0.980078 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0009  putative methylase  44.44 
 
 
227 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.57 
 
 
305 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.76 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.78 
 
 
302 aa  51.2  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  35.94 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.06 
 
 
284 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>