116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3275 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 596 aa  1243    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  33.68 
 
 		 540 aa  257  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0950  hypothetical protein  26.41 
 
 		 501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0387274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.73 
 
 		 739 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  25.54 
 
 		 852 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0059  hypothetical protein  25.98 
 
 		 947 aa  103  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1177  hypothetical protein  24.91 
 
 		 920 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0642948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3558  hypothetical protein  24.91 
 
 		 920 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1494  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.23 
 
 		 1068 aa  101  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0814  hypothetical protein  23.44 
 
 		 992 aa  100  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0772637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1119  hypothetical protein  36.5 
 
 		 1030 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0310  DNA methylase N-4/N-6  23.77 
 
 		 599 aa  94.4  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  26.65 
 
 		 934 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  24.52 
 
 		 916 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  26.23 
 
 		 878 aa  78.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  26.39 
 
 		 936 aa  77.4  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  23.46 
 
 		 894 aa  69.3  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.17 
 
 		 947 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1184  adenine-specific DNA methylase  28.74 
 
 		 610 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  39.77 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  30.82 
 
 		 416 aa  67  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1071 aa  65.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.48 
 
 		 651 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  22.33 
 
 		 892 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  23.27 
 
 		 920 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  35.35 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  25.1 
 
 		 967 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1045 aa  60.8  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1118 aa  60.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  39.33 
 
 		 281 aa  60.1  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  42.42 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  31.03 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  47.22 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  21.61 
 
 		 982 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  23.92 
 
 		 751 aa  56.6  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1070 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  41.1 
 
 		 259 aa  55.5  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  24.12 
 
 		 996 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  39.19 
 
 		 259 aa  55.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  23.18 
 
 		 747 aa  54.7  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1003 aa  54.3  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1106 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.72 
 
 		 391 aa  53.5  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  34 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  28.7 
 
 		 374 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  28.23 
 
 		 731 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.84 
 
 		 368 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2419  hypothetical protein  25.46 
 
 		 361 aa  51.6  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  39.39 
 
 		 544 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.51 
 
 		 372 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25 
 
 		 737 aa  51.2  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.21 
 
 		 371 aa  50.8  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.68 
 
 		 276 aa  50.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.82 
 
 		 545 aa  50.4  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  24.54 
 
 		 746 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  40.3 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  32.73 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.65 
 
 		 267 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.26 
 
 		 372 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  21.3 
 
 		 937 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.86 
 
 		 322 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.92 
 
 		 309 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 		 222 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  45.45 
 
 		 407 aa  47.4  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04295  hypothetical protein  32.56 
 
 		 377 aa  47.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.19 
 
 		 524 aa  47.4  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  34.21 
 
 		 418 aa  47.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  39.66 
 
 		 246 aa  47.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  25.37 
 
 		 911 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.53 
 
 		 703 aa  47  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3289  DNA methylase N-4/N-6  40.3 
 
 		 218 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.37 
 
 		 911 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.28 
 
 		 849 aa  46.6  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  36.78 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  40.38 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.62 
 
 		 733 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.3 
 
 		 255 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.57 
 
 		 370 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.38 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  35.29 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.82 
 
 		 271 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.76 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  42.22 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  23.15 
 
 		 960 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.43 
 
 		 308 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  34.25 
 
 		 348 aa  45.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.43 
 
 		 308 aa  45.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1491  adenine specific DNA-methyltransferase  36.11 
 
 		 779 aa  45.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00364069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2524  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.62 
 
 		 368 aa  45.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000139446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.04 
 
 		 633 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0547  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 752 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.392041  normal  0.581045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  35.29 
 
 		 433 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1172  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.61 
 
 		 366 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  40.35 
 
 		 421 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.3 
 
 		 225 aa  44.7  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.55 
 
 		 353 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 		 327 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  40.68 
 
 		 512 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>