212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6722 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  100 
 
 
292 aa  574  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  52.48 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  50.36 
 
 
305 aa  261  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  28.46 
 
 
481 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  24.61 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.35 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  30.32 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.46 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.89 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  21.96 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.1 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.46 
 
 
372 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  44.44 
 
 
463 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.17 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  32.32 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  27.04 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  28.18 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8574  hypothetical protein  31.38 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0679954  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  28.03 
 
 
351 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  50 
 
 
416 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  27.27 
 
 
350 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  34.57 
 
 
483 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.89 
 
 
372 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.03 
 
 
353 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.4 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  48.61 
 
 
225 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  35.14 
 
 
418 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  31.58 
 
 
317 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.32 
 
 
276 aa  53.1  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  35.96 
 
 
270 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0708  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.71 
 
 
545 aa  52.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.67 
 
 
327 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  27.27 
 
 
350 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  25.53 
 
 
367 aa  53.1  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  24.65 
 
 
315 aa  52.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  34.01 
 
 
709 aa  52.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  30 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.65 
 
 
273 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.65 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  31.19 
 
 
346 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3357  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
225 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0203  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 
319 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  39.44 
 
 
540 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.15 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3164  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
225 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0356148  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.1 
 
 
382 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.91 
 
 
375 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1440  DNA methylase  50.98 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.294057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4304  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.45 
 
 
874 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3747  putative methyltransferase  32.95 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000140856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.53 
 
 
597 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  40.68 
 
 
599 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  27.22 
 
 
344 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.23 
 
 
359 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.68 
 
 
599 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  28.09 
 
 
535 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0550  site-specific DNA-methyltransferase, putative  44.9 
 
 
250 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.20676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  30.43 
 
 
311 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3557  putative methyltransferase  32.95 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00430538  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.25 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.52 
 
 
355 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1172  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.54 
 
 
366 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1421  site-specific DNA-methyltransferase  44 
 
 
251 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.171704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2539  hypothetical protein  37.93 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.27 
 
 
368 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.59 
 
 
334 aa  49.3  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1044  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.24 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1213  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  32 
 
 
470 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3645  putative methyltransferase  31.82 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000318659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  27.81 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.23 
 
 
849 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.88 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  34.11 
 
 
368 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.88 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  26.36 
 
 
364 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.32 
 
 
947 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03120  predicted methyltransferase  31.82 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0444  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.82 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03071  hypothetical protein  31.82 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  30.36 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4579  putative methyltransferase  31.82 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026019  normal  0.14101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0444  putative methyltransferase  31.82 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0634628  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.76 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.21 
 
 
396 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.28 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.1 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  34.21 
 
 
412 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.17 
 
 
524 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.78 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3455  putative methyltransferase  31.82 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000495763  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.31 
 
 
222 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  32.5 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  30 
 
 
318 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  34.85 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0454  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.78 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.558336  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  34.48 
 
 
304 aa  47  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.71 
 
 
367 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.94 
 
 
329 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.38 
 
 
329 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>