12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2734 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2734  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2539  hypothetical protein  76.84 
 
 		 270 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1687  hypothetical protein  59.11 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00398874  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  38.74 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8574  hypothetical protein  37.82 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0679954  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  37.5 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  51.16 
 
 		 463 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  24.42 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.18 
 
 		 279 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  40.91 
 
 		 315 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  35.56 
 
 		 596 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>