187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0953 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  755    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  77.69 
 
 
372 aa  592  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  56.68 
 
 
375 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  57.62 
 
 
368 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  56.21 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  58.28 
 
 
371 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50.58 
 
 
257 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1511  DNA methylase N-4/N-6  32.71 
 
 
329 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0306  putative RNA methylase  32.14 
 
 
259 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0220171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0460  putative RNA methylase  35.51 
 
 
259 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.258821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1038  putative RNA methylase  30.71 
 
 
249 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0871  hypothetical protein  31.67 
 
 
281 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1590  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.49 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000278078  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0829  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.12 
 
 
246 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2386  hypothetical protein  34.84 
 
 
459 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.65 
 
 
416 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.96 
 
 
308 aa  67  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.96 
 
 
308 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2383  DNA modification methylase-like protein  25.28 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.389013  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0442  putative RNA methylase  27.48 
 
 
258 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0815  hypothetical protein  34.97 
 
 
308 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  hitchhiker  0.00116445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.67 
 
 
441 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  38.46 
 
 
292 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  44.29 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  40 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0021  DNA modification methylase-like protein  28.74 
 
 
481 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  26.53 
 
 
305 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2920  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25 
 
 
309 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.71 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  30.95 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  32.46 
 
 
421 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.71 
 
 
597 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  41.67 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.8 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  46.51 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.99 
 
 
302 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  38.03 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4192  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.94 
 
 
267 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291791 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.21 
 
 
429 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.43 
 
 
274 aa  53.5  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.63 
 
 
256 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  31.3 
 
 
483 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.91 
 
 
528 aa  53.1  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  38.33 
 
 
535 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  32.38 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1466  adenine-specific DNA-methyltransferase-like protein  29 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307706  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.81 
 
 
293 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.67 
 
 
524 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  36.99 
 
 
450 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.16 
 
 
947 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  47.92 
 
 
293 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  37.97 
 
 
409 aa  50.8  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  34.29 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.18 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.06 
 
 
483 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1480  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.67 
 
 
255 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.292437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  41.67 
 
 
464 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  27.27 
 
 
374 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  44.3 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  28.17 
 
 
530 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 
446 aa  50.1  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.11 
 
 
849 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  31.17 
 
 
418 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3043  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.03 
 
 
375 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00264807  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 
360 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.2 
 
 
271 aa  49.7  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  50 
 
 
540 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  30.88 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2126  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.86 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.03 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.43 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.21 
 
 
292 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  38.16 
 
 
475 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  43.18 
 
 
315 aa  49.3  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  41.18 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  43.59 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  44.19 
 
 
436 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.76 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  32.26 
 
 
596 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1826  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  46.55 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.38 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.85 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2495  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.14 
 
 
601 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04295  hypothetical protein  28.46 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  56.41 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  48.98 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0283  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.03 
 
 
292 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.63 
 
 
488 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.22 
 
 
222 aa  47.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.38 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0560  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.94 
 
 
323 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0004  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.27 
 
 
396 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.0090313 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.34 
 
 
315 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.93 
 
 
739 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1282  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.78 
 
 
271 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0717608  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30 
 
 
412 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.86 
 
 
373 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>