More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1578 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 		 483 aa  982    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0806  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.74 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0878  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  43.22 
 
 		 464 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643395  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1452  DNA methylase N-4/N-6  44.12 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0803  DNA methylase N-4/N-6  38.68 
 
 		 436 aa  292  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0747571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2655  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  38.41 
 
 		 421 aa  253  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3216  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.77 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.676977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2277  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.35 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0946567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0845  hypothetical protein  35.45 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.307367  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0263  prophage LambdaW1, DNA methylase  30.59 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0594  prophage LambdaW4, DNA methylase  31.1 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0766546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1318  nuclease  32.59 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2583  nuclease  32.59 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2753  nuclease  32.59 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0653  nuclease  32.88 
 
 		 459 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2055  nuclease  32.15 
 
 		 448 aa  199  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00544489  normal  0.0145428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2825  nuclease  31.93 
 
 		 448 aa  196  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1092  DNA methylase  31.95 
 
 		 421 aa  196  9e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2068  nuclease  33.1 
 
 		 463 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0392  DNA methylase, family protein  31.23 
 
 		 413 aa  191  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1249  nuclease  32.21 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.535856  normal  0.132428 
 
 
-
 
NC_002936  DET0066  DNA methylase  30.84 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2842  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.81 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1244  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.9 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2905  nuclease  31.76 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117629  normal  0.708215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1638  ParB-like nuclease  30.64 
 
 		 417 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0822558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1729  DNA methylase N-4/N-6  29.55 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1546  DNA methylase N-4/N-6  30.21 
 
 		 470 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.572545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3217  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.53 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.77024  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2654  prophage LambdaMc01, DNA methyltransferase  30.26 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1480  ParB-like nuclease domain-containing protein  30.13 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1639  DNA methylase N-4/N-6  27.05 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0959  nuclease  26.93 
 
 		 396 aa  147  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273915 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0844  hypothetical protein  30 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0872  nuclease  37.62 
 
 		 684 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2276  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  30.12 
 
 		 403 aa  124  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.265094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS06032  hypothetical protein  35.83 
 
 		 222 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  27.34 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.63 
 
 		 368 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1597  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.4 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111041 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3400  nuclease  38.26 
 
 		 200 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360285  hitchhiker  0.000000903225 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0495  modification methylase BabI  26.94 
 
 		 386 aa  86.7  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0491  modification methylase BabI  26.94 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.598468  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0763  DNA adenine methylase CcrM  28.99 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.02 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.26 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.5 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.52 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0828  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.07 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  30.73 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  27.31 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.86 
 
 		 380 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1308  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.17 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.34 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1173  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.95 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  29.17 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0710  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.69 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.9 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2332  DNA adenine methylase CcrM  28.33 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.160434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1962  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.58 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0117  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.44 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00741013  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0816  ParB-like nuclease  36.51 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.207727  hitchhiker  0.00120051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  29.29 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1218  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.56 
 
 		 376 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4366  DNA methylase N-4/N-6  28.44 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.436205  normal  0.0199247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2942  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.6 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.38 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2855  DNA methylase N-4/N-6  28.1 
 
 		 285 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0194641  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  26.81 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.68 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3036  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.6 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0660763  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4927  nuclease  29.6 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.603092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.99 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.04 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1200  DNA methylase N-4/N-6  27.67 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0534  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.22 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000146587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  26.92 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1073  DNA methylase N-4/N-6  26.8 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3028  hypothetical protein  66.07 
 
 		 56 aa  73.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  26.34 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2603  DNA methylase N-4/N-6  27.31 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.592749  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.64 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.47 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.73 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1409  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.27 
 
 		 243 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3225  DNA methylase N-4/N-6  26.91 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.73 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  28.15 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2337  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.17 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.628508 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.15 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3181  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.11 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3505  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.11 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.602417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2231  ParB family protein  31.82 
 
 		 169 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.119979  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.17 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3376  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.54 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4924  nuclease  28.74 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.180395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0686  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.14 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000562829  hitchhiker  2.64678e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1911  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.18 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01365  DNA methylase  29.55 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.255281  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  26.56 
 
 		 367 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.723409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>