105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0909 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  100 
 
 		 535 aa  1119    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  64.19 
 
 		 530 aa  720    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  61.83 
 
 		 528 aa  706    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  54.73 
 
 		 524 aa  605  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  30.86 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  30.36 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  40.66 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  36.7 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  44.32 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  23.86 
 
 		 947 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  33.68 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  32.5 
 
 		 614 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2450  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  41.67 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  28 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  41.03 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  21.39 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.59 
 
 		 383 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  26.38 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  34.69 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  38.16 
 
 		 483 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.26 
 
 		 371 aa  54.3  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  25.58 
 
 		 467 aa  54.3  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  56.76 
 
 		 315 aa  54.3  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  27.93 
 
 		 146 aa  53.9  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.18 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0953  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.33 
 
 		 372 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.752338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  31.03 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  55.81 
 
 		 370 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1246  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.59 
 
 		 293 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0940338  hitchhiker  0.00345461 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  26.72 
 
 		 444 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  31.18 
 
 		 407 aa  50.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  28.47 
 
 		 412 aa  50.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  32.93 
 
 		 737 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  59.38 
 
 		 380 aa  50.4  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6722  putative RNA methylase  28.09 
 
 		 292 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  34.52 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  33.8 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.77 
 
 		 414 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.94 
 
 		 597 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  48.72 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3051  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.41 
 
 		 305 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1471  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  68.75 
 
 		 276 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  26.17 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6933  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45.83 
 
 		 327 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0266817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  38.1 
 
 		 393 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.99 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.68 
 
 		 849 aa  47.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  40.68 
 
 		 375 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000888828  hitchhiker  0.0000001156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0038  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.5 
 
 		 257 aa  47.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.91 
 
 		 274 aa  47.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 		 271 aa  47  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0875  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.39 
 
 		 281 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000314247  unclonable  0.00000000054829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  34.21 
 
 		 475 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2104  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  51.16 
 
 		 269 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.636734  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  35.21 
 
 		 747 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  50 
 
 		 703 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1518  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.92 
 
 		 284 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  36.78 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  46.81 
 
 		 279 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  33.33 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2118  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  42.31 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0790  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.75 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  29.7 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  56.76 
 
 		 731 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.5 
 
 		 370 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  42.37 
 
 		 369 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3628  DNA methylase N-4/N-6  58.06 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  35.06 
 
 		 438 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  26.44 
 
 		 366 aa  45.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  34.72 
 
 		 411 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  28.07 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  63.33 
 
 		 356 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3766  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  58.06 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0871751  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05110  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.78 
 
 		 386 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4087  putative RNA methylase  27.27 
 
 		 329 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134174  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  28.07 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  27.86 
 
 		 367 aa  44.3  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  51.43 
 
 		 544 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1578  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  35.8 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  32.22 
 
 		 464 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  54.55 
 
 		 351 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  29.27 
 
 		 433 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6843  putative RNA methylase  23.24 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  32.61 
 
 		 852 aa  44.3  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  34.78 
 
 		 751 aa  44.3  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0569  DNA methylase N-4/N-6  47.22 
 
 		 215 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  26.58 
 
 		 346 aa  44.3  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4172  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 		 972 aa  44.3  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  54.55 
 
 		 350 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  40 
 
 		 472 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1611  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.5 
 
 		 226 aa  44.3  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2428  hypothetical protein  40 
 
 		 343 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.939797  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0120  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  47.73 
 
 		 225 aa  43.9  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0225106 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0591  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.35 
 
 		 308 aa  43.9  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000342774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  51.35 
 
 		 308 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000183696  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2856  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 		 938 aa  43.9  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3573  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.57 
 
 		 306 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.116756  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0469  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.46 
 
 		 256 aa  43.9  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321742  normal  0.0206265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0200  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  44.44 
 
 		 896 aa  43.9  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>