53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3873 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  69.09 
 
 
441 aa  638    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  901    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  901    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  33.72 
 
 
445 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  32.08 
 
 
414 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  30.79 
 
 
416 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  31.78 
 
 
408 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  27.12 
 
 
472 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  30.62 
 
 
313 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  25.48 
 
 
444 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  25.12 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  30.77 
 
 
433 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  23.48 
 
 
475 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  24.62 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.85 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  22.22 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  23.73 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  25.18 
 
 
482 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  21.2 
 
 
464 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.41 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  25 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  24.94 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.1 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  22.39 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  21.35 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.78 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  24.18 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  23.02 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  22.66 
 
 
463 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  26.48 
 
 
877 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  22.77 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.27 
 
 
947 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  21.18 
 
 
474 aa  57  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  21.05 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  35.14 
 
 
476 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  23.23 
 
 
453 aa  53.1  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2187  hypothetical protein  34.33 
 
 
110 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  21.88 
 
 
461 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  29.9 
 
 
528 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  34.85 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  19.75 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  27.19 
 
 
530 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  21.32 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2184  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.71 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  31.76 
 
 
512 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  28.07 
 
 
535 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.45 
 
 
524 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0969  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  43.33 
 
 
222 aa  44.3  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.893319  hitchhiker  0.0000000140587 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  22.36 
 
 
433 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3593  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  45 
 
 
372 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.316349  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  22.91 
 
 
393 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  25.84 
 
 
747 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0114  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.94 
 
 
353 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>