64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0374 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  302  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  63.85 
 
 		 467 aa  180  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  52.11 
 
 		 947 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  35.71 
 
 		 438 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  43.37 
 
 		 393 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  38.71 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  37.89 
 
 		 416 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  40.28 
 
 		 483 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  31.78 
 
 		 453 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  34.48 
 
 		 418 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.03 
 
 		 524 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.95 
 
 		 414 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  37.37 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  36.84 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  37.97 
 
 		 412 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  27.93 
 
 		 535 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  30.08 
 
 		 366 aa  52.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  34.48 
 
 		 463 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  29.82 
 
 		 374 aa  51.2  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  28.97 
 
 		 530 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.47 
 
 		 633 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  30.17 
 
 		 614 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  35.71 
 
 		 414 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  35.35 
 
 		 877 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  31.13 
 
 		 482 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  46.81 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 596 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  34.07 
 
 		 407 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  37.04 
 
 		 421 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  27.19 
 
 		 444 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.1 
 
 		 528 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  35.44 
 
 		 410 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.49 
 
 		 739 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  29.17 
 
 		 495 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  33.77 
 
 		 430 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  25.83 
 
 		 441 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  38.81 
 
 		 731 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  30.49 
 
 		 450 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0639  DNA methylase N-4/N-6  27.42 
 
 		 852 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  32.65 
 
 		 512 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  30.59 
 
 		 475 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  28.18 
 
 		 417 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.73 
 
 		 383 aa  43.5  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  45.24 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  50 
 
 		 960 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  44.19 
 
 		 369 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.87 
 
 		 310 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  30.12 
 
 		 433 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  50 
 
 		 792 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  34.72 
 
 		 297 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  34.72 
 
 		 284 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  40.82 
 
 		 408 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  34.72 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  34.72 
 
 		 317 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  32.1 
 
 		 703 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  47.22 
 
 		 937 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  35.29 
 
 		 967 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  32.76 
 
 		 916 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  33.33 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  25.47 
 
 		 411 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1055  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.8 
 
 		 849 aa  40  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000157491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  45.95 
 
 		 920 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>