50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3691 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  67.34 
 
 		 408 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  42.81 
 
 		 414 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  44.93 
 
 		 416 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  41.75 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  30.62 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  30.62 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  31.15 
 
 		 445 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  29.57 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  28.21 
 
 		 433 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.49 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  26.34 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  21.78 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  24.45 
 
 		 475 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  26.24 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  26.13 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  25.51 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  25.65 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  24.03 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  28.96 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  25 
 
 		 495 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  23.64 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  25.83 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  22.76 
 
 		 431 aa  55.8  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.6 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  24.48 
 
 		 483 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  26 
 
 		 418 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.87 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.12 
 
 		 633 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  21 
 
 		 463 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.88 
 
 		 477 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.62 
 
 		 877 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  21.69 
 
 		 453 aa  50.4  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  39.71 
 
 		 474 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  46.81 
 
 		 146 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  26.88 
 
 		 482 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  22.56 
 
 		 412 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  26.67 
 
 		 412 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  26.16 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  22.43 
 
 		 512 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  20.65 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  39.29 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  34.18 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  40.3 
 
 		 524 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  31.25 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  30.67 
 
 		 596 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  23.53 
 
 		 433 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  38.6 
 
 		 380 aa  42.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  23.17 
 
 		 441 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 211 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>