60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2251 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  794    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  32.8 
 
 		 483 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  28.1 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  27.86 
 
 		 467 aa  113  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  27.29 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  25.95 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.7 
 
 		 947 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  23.81 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  26.89 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  26.3 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  23.83 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  22.93 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  26.89 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  24.74 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  24.06 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.21 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  23.39 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.1 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  24.86 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  25.66 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  23.44 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  25.71 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  43.37 
 
 		 146 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  31.12 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  24.33 
 
 		 433 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  21.18 
 
 		 444 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  23.45 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5156  hypothetical protein  24.46 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000726262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  23.84 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  27.97 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  28.96 
 
 		 313 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  25.18 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  23.47 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  24.65 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  25.14 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.7 
 
 		 482 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.55 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  22.56 
 
 		 476 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.32 
 
 		 633 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  22.36 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  28.57 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  21.57 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.26 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  38.6 
 
 		 731 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  19.16 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  33.33 
 
 		 916 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  30.68 
 
 		 878 aa  46.6  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  23.21 
 
 		 614 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  20.81 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.56 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  20.77 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1717  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.98 
 
 		 739 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000410476  hitchhiker  0.00177802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  52.5 
 
 		 271 aa  44.3  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  27.84 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26692  predicted protein  25.99 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281046  decreased coverage  0.00284905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  23.25 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  24.42 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  30.65 
 
 		 877 aa  43.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  47.22 
 
 		 746 aa  43.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.33 
 
 		 528 aa  42.7  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>