51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2389 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  100 
 
 
369 aa  755    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3926  putative DNA modification methylase  42.51 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1953  putative DNA modification methylase  47.79 
 
 
163 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.113562  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.84 
 
 
633 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26 
 
 
414 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  28.15 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  25.64 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00415  adenine-specific DNA modification methyltransferase  26.78 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.530575  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  26.14 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  26.43 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0737  hypothetical protein  26.55 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00870561  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  23.42 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  22.98 
 
 
877 aa  58.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  27.34 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  21.64 
 
 
432 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  22.73 
 
 
430 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  27.13 
 
 
433 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  39.76 
 
 
947 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  35.42 
 
 
450 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.17 
 
 
444 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  23.18 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  46.67 
 
 
441 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  27.12 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  43.64 
 
 
416 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  34.85 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  34.85 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  33.33 
 
 
614 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  36.62 
 
 
433 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  21.37 
 
 
431 aa  46.6  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  26.16 
 
 
313 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  38.71 
 
 
435 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  24.71 
 
 
482 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  42.86 
 
 
418 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  40.35 
 
 
483 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.9 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1071  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.71 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  42.37 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  31.75 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  56.1 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  37.68 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  42.37 
 
 
535 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  40.32 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  32.89 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  44.19 
 
 
146 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  41.54 
 
 
296 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48.84 
 
 
356 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  24.42 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4235  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  50 
 
 
459 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.19 
 
 
524 aa  43.1  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  50 
 
 
429 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4152  DNA methylase N-4/N-6  34.21 
 
 
544 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>