54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2226 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  961    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0374  hypothetical protein  63.85 
 
 		 146 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000208638  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  25.12 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  27.68 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  27.86 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  27.75 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  24.44 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  26.52 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  27.38 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  23.49 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  23.37 
 
 		 463 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  26.86 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  22.84 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.17 
 
 		 947 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  22.15 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  23.82 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  24.18 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  23.81 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6814  hypothetical protein  26.1 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.823873  normal  0.941535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0642  hypothetical protein  23.49 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  22.11 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4077  hypothetical protein  23.9 
 
 		 614 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  25.31 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  22.87 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  26.2 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  26.13 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.52 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1426  hypothetical protein  25 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  24.59 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  21.89 
 
 		 475 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  21.93 
 
 		 524 aa  57  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  23.75 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.58 
 
 		 633 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  25 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0909  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  25.58 
 
 		 535 aa  54.3  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.90275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1620  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.74 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  21.31 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0332  type II DNA modification methyltransferase M.TdeIII  27.27 
 
 		 530 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00994221  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  20.75 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3275  adenine-specific DNA methylase  40.3 
 
 		 596 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.762851  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  25.81 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  23.35 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0684  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.12 
 
 		 528 aa  47.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  21.86 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  25.75 
 
 		 476 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  30.53 
 
 		 366 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2206  methyltransferase DNA modification enzyme  38.46 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.612218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  44.68 
 
 		 512 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2731  methyltransferase DNA modification enzyme  24.45 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  41.3 
 
 		 996 aa  45.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  40.32 
 
 		 369 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  22.49 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  44.68 
 
 		 967 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1386  adenine-specific DNA methylase  29.13 
 
 		 540 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0156455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>