49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0958 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  854    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3691  hypothetical protein  67.34 
 
 		 313 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1122  DNA methyltransferase  43.21 
 
 		 416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.909173  normal  0.0173084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1000  DNA methyltransferase  43.1 
 
 		 472 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1306  hypothetical protein  38.41 
 
 		 414 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000125163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4787  hypothetical protein  29.51 
 
 		 441 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3873  hypothetical protein  31.78 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3922  hypothetical protein  31.78 
 
 		 439 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0070396  normal  0.271721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0894  hypothetical protein  28.5 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.118931  hitchhiker  0.00000342492 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00410  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.65 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2284  hypothetical protein  24.77 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1872  hypothetical protein  24.08 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.682405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4397  hypothetical protein  26.4 
 
 		 475 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.050702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0068  hypothetical protein  22.12 
 
 		 464 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00010049  hitchhiker  0.00158155 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0325  hypothetical protein  24.61 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.103576  hitchhiker  0.00000188519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1833  hypothetical protein  23.96 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1303  adenine-specific DNA methylase  22.31 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5607  modification methylase, putative  21.28 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0295584  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1917  putative modification methylase  22.93 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419467  hitchhiker  0.0000000000400101 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1658  adenine-specific DNA methylase  22.7 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000448906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1233  hypothetical protein  24.37 
 
 		 438 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241867  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2226  hypothetical protein  22.11 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1456  putative RNA methylase  21.8 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2251  hypothetical protein  23.45 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1918  putative modification methylase  22.26 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00266275  hitchhiker  0.00000000000360377 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0227  adenine-specific DNA modification methyltransferase  21.88 
 
 		 877 aa  63.5  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0765559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2828  hypothetical protein  22.19 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3799  putative RNA methylase  23.01 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4009  hypothetical protein  23.74 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000517991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4038  putative RNA methylase  21.14 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00846703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3798  putative RNA methylase  24.4 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.4 
 
 		 947 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3012  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  21.48 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0931  adenine-specific DNA methylase  22.69 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316794  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5606  modification methylase, putative  23.7 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3181  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  24.87 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4359  hypothetical protein  21.23 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000708265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0407  site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-specific)  20.81 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0329  hypothetical protein  22.36 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2389  putative DNA modification methylase  23.18 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.198556  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1242  modification methylase  19.7 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00503065  hitchhiker  0.00000000592753 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1681  cyclase family protein  19.92 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.259173  hitchhiker  0.0000210949 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1725  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.76 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110429  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3603  adenine-specific DNA methylase  21.72 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 261 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.04 
 
 		 633 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0328  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.56 
 
 		 383 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0843  Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine- N(4)-specific)  19.77 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3051  methyltransferase DNA modification enzyme  19.86 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>